在共同犯罪中，若存在两个主犯且其中一人为法人，司法机关会依据各自犯罪事实、情节及法律规定分别定罪量刑，法人作为主犯将面临双重责任（刑事与行政/民事），自然人主犯则按其参与程度承担相应刑事责任。以下从不同角度展开分析：

一、主犯认定与责任划分

1. 主犯的认定标准
   根据《刑法》第二十六条，主犯是指组织、领导犯罪集团进行犯罪活动或在共同犯罪中起主要作用的人。若法人与自然人共同实施犯罪，且均符合主犯条件（如法人决策实施犯罪、自然人具体执行关键环节），则二者均会被认定为主犯。

2. 责任划分原则

   • 法人责任：法人作为拟制主体，需承担与其犯罪行为相关的刑事责任（如单位犯罪中的罚金刑）及行政/民事责任（如赔偿、罚款）。
     
   • 自然人责任：直接负责的主管人员和其他直接责任人员（如法人代表、高管或具体执行者）需承担个人刑事责任，刑罚种类包括有期徒刑、罚金等。

二、法人作为主犯的特殊处理

1. 单位犯罪的双重责任
   若犯罪行为被认定为单位犯罪（如法人集体决策实施诈骗），则法人需缴纳罚金，同时直接责任人员（如法人代表、决策层）需承担个人刑事责任。例如，在非法集资案中，法人可能被判处罚金，而法人代表可能因“直接负责的主管人员”身份被判处有期徒刑。

2. 法人与自然人责任独立
   法人的刑事责任不免除自然人的刑事责任。即使法人已承担罚金，自然人仍需根据其参与程度（如策划、指挥、实施）被单独定罪量刑。例如，在环境污染案中，法人可能因违法排污被罚款，而具体操作人员可能因“直接责任人员”身份被追究污染环境罪。

三、自然人主犯的定罪量刑

1. 参与程度决定刑罚
   自然人主犯的刑罚需根据其在犯罪中的具体作用（如是否起组织、策划、指挥作用）确定。例如，在共同盗窃案中，若自然人主犯负责踩点、分工，可能被认定为“主犯”并从重处罚；若仅参与部分环节，可能被认定为“从犯”并减轻处罚。

2. 数罪并罚的可能性
   若自然人主犯同时涉及多个犯罪行为（如既参与诈骗又参与洗钱），司法机关可能对其数罪并罚，合并执行刑罚。

四、实务建议

1. 法人层面：

   • 完善合规制度，避免决策层集体陷入犯罪风险；
     
   • 犯罪后积极配合调查，争取从轻处罚（如自愿缴纳罚金、赔偿损失）。
     

2. 自然人层面：

   • 明确自身在犯罪中的角色，避免被错误认定为主犯；
     
   • 若已涉案，尽早委托律师介入，通过自首、立功等情节争取减轻处罚。

如有具体案件细节（如犯罪类型、参与程度等），可进一步向我咨询，我将结合法律条文与司法实践为您详细分析。