针对“一个法人两家公司违法怎么办”这一问题，核心在于明确同一法人名下两家公司出现违法行为时的法律责任承担与处理方式。以下是具体分析：
法人责任与公司责任的独立性
根据《公司法》第三条，公司是企业法人，拥有独立的法人财产和责任。即使两家公司的法定代表人为同一人，两家公司仍需独立承担各自的法律责任。例如：
- 若A公司因污染环境被处罚，B公司因偷税漏税被追责，两家公司的违法行为互不关联，需分别承担行政或刑事责任。
- 法定代表人个人若未直接参与违法行为（如未指使、授意或协助），通常不直接承担公司违法责任，但需配合调查（如提供资料、接受询问）。
法定代表人可能承担的连带责任情形
若法定代表人存在以下行为，可能需对公司违法承担个人责任：
- 直接参与违法：如指使员工伪造账目、亲自实施污染行为等，可能被追究行政处罚（如罚款、拘留）或刑事责任（如污染环境罪、逃税罪）。
- 未履行法定义务：如公司未依法纳税，法定代表人作为直接责任人员可能被税务机关处罚；公司未按时年报，法定代表人可能被列入失信名单。
- 公司财产与个人财产混同：若法定代表人将公司财产据为己有（如挪用资金），可能构成职务侵占罪或抽逃出资罪。
处理建议
- 立即停止违法行为：若两家公司仍在违法经营（如继续排污、虚开发票），需第一时间终止，避免责任扩大。
- 配合调查与整改：主动向监管部门说明情况，提交整改方案（如补缴税款、修复环境），争取从轻或减轻处罚。
- 区分责任主体：若违法行为仅涉及一家公司，需明确另一家公司未参与，避免被“牵连处罚”（如行政机关误将两家公司视为同一主体处罚）。
- 法律程序应对：若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼；若涉及刑事犯罪，需委托律师介入辩护。
总结：同一法人名下两家公司违法时，需先明确违法行为主体，由涉事公司独立承担责任；若法定代表人存在过错或违法行为，可能被追责。建议立即停止违法、配合调查，并区分责任主体以降低风险。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。