结论：在代理打电话寻标回复错误导致被废标，但标书本身没问题的情况下，您仍然有权提出异议，但能否成功需视具体情况和招标文件规定而定。以下从多个角度为您详细分析：
一、异议的提出权利
法律依据：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，投标人或者其他利害关系人认为招标投标活动不符合法律、行政法规规定的，有权向招标人提出异议。因此，在您描述的情况下，您作为投标人，有权对废标决定提出异议。
异议内容：您的异议应主要围绕废标决定的合法性、合理性进行，指出代理打电话寻标回复错误并非废标的法定理由，且标书本身没有问题，不应因此被废标。
二、异议的成功可能性
招标文件规定：首先，您需要仔细审查招标文件，看其中是否明确规定了因代理回复错误导致废标的情形。如果招标文件没有此类规定，那么废标决定可能缺乏合法依据，您的异议成功可能性较大。
错误性质与影响：其次，您需要评估代理打电话寻标回复错误的性质和影响。如果该错误并未对招标活动的公平、公正、公开原则造成实质性影响，且标书内容确实符合招标要求，那么您的异议更有可能得到支持。
证据收集：为了支持您的异议，您需要收集相关证据，如标书原件、代理回复错误的记录、与招标人的沟通记录等，以证明您的标书没有问题，且废标决定缺乏合法依据。
三、异议的处理流程
提出异议：您应在知道或者应当知道废标决定之日起一定期限内（具体期限根据招标文件或相关法律法规确定），向招标人提出书面异议，并附上相关证据材料。
招标人处理：招标人收到异议后，应在规定期限内作出答复。如果招标人认为异议成立，可能会撤销废标决定，重新进行评标或采取其他补救措施；如果招标人认为异议不成立，应说明理由，并告知您有权向有关行政监督部门投诉。
投诉与诉讼：如果您对招标人的答复不满意，还可以向有关行政监督部门投诉，或者依法向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
四、建议与注意事项
及时行动：一旦发现废标决定可能存在问题，您应尽快提出异议，以免错过法定时限。
专业咨询：在处理此类纠纷时，建议您咨询专业律师的意见，以确保您的异议内容合法、有力，并提高异议成功的可能性。
保持沟通：在异议处理过程中，与招标人保持积极沟通，了解处理进展，有助于更好地维护自己的权益。
如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。