医疗机构若违反法律规定出租、承包医疗科室，将面临以下处罚：
没收非法所得：
- 卫生行政部门将依法收缴医疗机构通过违法出租、承包行为获取的不当经济利益。这是对其违法行为的直接经济制裁，旨在剥夺其因违法行为而获得的利益。
罚款：
- 根据违法行为的情节轻重，罚款额度有所不同。一般情况下，可能处以三千元以下的罚款；若情节严重，如出卖许可证、以营利为目的转让或出借、给患者造成伤害等，罚款额度将提升至三千元以上五千元以下。特别地，对于出租、承包行为，根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》，罚款可能为违法所得的二倍以上十倍以下，这显示了法律对这类违法行为的严厉打击态度。
吊销《医疗机构执业许可证》：
- 对于情节特别严重或存在特定违法情形的医疗机构，卫生行政部门将吊销其《医疗机构执业许可证》。这意味着该医疗机构将失去合法执业资格，无法再继续开展诊疗活动。这是对其违法行为的终极制裁，旨在彻底消除其继续违法的可能性。
处罚流程：
- 立案：卫生行政部门在发现医疗机构存在出租、承包医疗科室的违法行为后，将进行初步审查，并决定是否立案调查。
- 调查取证：立案后，卫生行政部门将进行深入调查，收集相关证据，确保事实清楚、证据确凿。
- 告知与听证：在作出行政处罚决定前，卫生行政部门将告知医疗机构相关事实和依据，并保障其陈述申辩、听证等权利。
- 决定与送达：依法作出行政处罚决定后，卫生行政部门将制作相关法律文书，并送达给医疗机构。
- 执行与监管：卫生行政部门将监督医疗机构履行行政处罚决定，对不自觉履行的将依法申请人民法院强制执行，并进行后续监督检查以确保整改到位。
法律背景与建议：
- 医疗机构出租、承包医疗科室的行为严重违反了《医疗机构管理条例》、《医疗机构管理条例实施细则》以及《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》等相关法律法规。这些法律法规的制定旨在维护医疗行业的正常秩序和公众的健康权益。
- 作为医疗机构，应严格遵守相关法律法规，不得将医疗科室出租、承包给非医疗机构或不符合条件的单位和个人开展诊疗活动。否则，将面临严厉的行政处罚和法律后果。
- 若医疗机构因出租、承包医疗科室而面临处罚，建议及时咨询专业律师，了解自身权益和义务，并积极配合卫生行政部门的调查和处理工作。同时，医疗机构也应加强内部管理，完善相关制度，防止类似违法行为再次发生。
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