公司账户被冻结后，工程款仍有途径可收，但需根据冻结原因和具体情况采取不同策略。以下分情况说明：

1. 若冻结因诉讼保全或执行程序导致

   • 沟通协商：立即联系冻结法院或申请执行人（如债权人），说明工程款涉及农民工工资、材料款等民生或第三方权益，争取解除冻结或部分解冻。需提供合同、付款记录等证据证明款项性质。
     
   • 提出异议：若冻结错误（如超标的冻结、非涉案款项），可向法院提交《执行异议申请书》，要求撤销冻结。需附上账户流水、工程款专项证明等材料。
     
   • 提供担保：若法院要求，可提供等值财产（如房产、车辆）或第三方担保，申请替换被冻结账户，恢复资金流动。

2. 若冻结因行政处罚（如税务、环保）

   • 履行义务：先补缴罚款或完成整改，再向行政机关申请解除冻结。例如，税务冻结需补缴税款及滞纳金后，凭完税证明申请解冻。
     
   • 行政复议/诉讼：若认为处罚不当，可在60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼，同时申请法院暂停冻结（需提供担保）。

3. 若冻结因刑事案件（如涉嫌诈骗、非法集资）

   • 配合调查：主动联系公安机关，说明工程款合法来源及用途，申请将款项划入专用监管账户，确保用于工程结算。
     
   • 申请退赔：若案件与工程无关，可向办案机关提交《退赔申请书》，要求将工程款排除在涉案财物范围外。

4. 替代收款方案

   • 变更收款账户：与发包方协商，将后续工程款支付至未被冻结的账户（如新开立账户、关联公司账户），但需确保新账户无涉诉风险。
     
   • 第三方代收：通过银行保函、信用证或第三方支付平台（如支付宝、微信）收款，但需发包方同意且符合合同约定。
     
   • 以物抵债：若发包方无力支付现金，可协商接受房产、设备等实物抵偿工程款，但需办理产权过户手续。

风险提示：

• 擅自转移被冻结资金可能构成“非法处置查封财产罪”，面临刑事责任。
  
• 协商或申请解冻时，务必保留书面证据（如沟通记录、法院文书），避免口头约定。
  

建议行动步骤：

1. 立即联系冻结机关，查明冻结原因及法律依据；
   
2. 评估工程款性质（是否涉及第三方权益、是否为涉案财物）；
   
3. 根据冻结原因选择上述对应策略，优先通过法律程序解决；
   
4. 同步与发包方沟通，确保工程进度不受影响，避免扩大损失。
   

如有进一步细节（如冻结机关、合同条款），可提供更多信息，我会为你定制更具体的解决方案。