在劳动仲裁中，如果公司有多个名称，员工应当告实际用工主体对应的公司名称，即与员工建立劳动关系、实际支付工资、进行管理的那个公司。以下是对此问题的详细分析：

一、确定实际用工主体

1. 劳动关系建立：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动关系自用工之日起建立。因此，关键在于确定哪个公司与员工建立了实际的劳动关系。这通常可以通过劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等证据来证明。

2. 实际用工情况：即使公司有多个名称，但实际用工的只有一个主体。员工应当关注与自己实际工作相关的公司，即那个支付工资、进行日常管理、安排工作任务的公司。

二、选择仲裁对象

1. 合同相对性原则：在劳动仲裁中，通常遵循合同相对性原则。即员工应当向与其建立劳动关系的公司提起仲裁。如果员工错误地选择了其他公司名称，可能会导致仲裁申请被驳回或仲裁结果不利于员工。

2. 证据收集：为了证明与某个公司的劳动关系，员工需要收集相关证据，如劳动合同、工资单、工作证、考勤记录、工作邮件、短信通知等。这些证据应当能够清晰地显示员工与哪个公司建立了劳动关系。

三、特殊情况处理

1. 关联公司或集团公司：如果公司有多个名称且属于关联公司或集团公司，员工需要仔细分析各公司之间的关系以及自己与哪个公司建立了劳动关系。在某些情况下，可能需要将多个公司列为共同被申请人，但这需要根据具体情况和证据来决定。

2. 公司名称变更：如果公司在员工工作期间发生了名称变更，员工应当以变更后的公司名称作为仲裁对象。同时，需要提供公司名称变更的相关证据，如工商变更登记记录等。

四、法律建议

1. 咨询专业律师：在提起劳动仲裁前，建议员工咨询专业律师，以更准确地确定仲裁对象和收集相关证据。律师可以根据员工的实际情况和证据情况，提供具体的法律建议和指导。

2. 准备充分证据：员工在提起仲裁前，应当尽可能收集与劳动关系相关的证据，以确保仲裁申请的合法性和有效性。证据的充分性和准确性对于仲裁结果具有至关重要的影响。

总结来说，在劳动仲裁中，员工应当根据实际用工主体来确定仲裁对象，即与员工建立劳动关系、实际支付工资、进行管理的那个公司。如果遇到特殊情况或不确定如何确定仲裁对象时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。