公司发放阴阳工资是违法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。公司发放阴阳工资，即实际支付给劳动者的工资与合同或申报的工资不一致，这明显违反了工资支付的透明性和真实性原则。
税务合规性：
- 阴阳工资往往涉及偷逃税款的问题。公司可能通过低报工资来减少应缴纳的社保和个税，这不仅损害了劳动者的合法权益，也违反了国家的税收法规。根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
法律后果
对劳动者的损害：
- 阴阳工资导致劳动者实际收入减少，影响了劳动者的生活质量和经济利益。同时，由于社保缴纳基数可能基于低报的工资，劳动者的社保权益也可能受到损害，如养老金、医疗保险等。
对公司的法律责任：
- 公司可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。如果涉及偷逃税款，还可能面临税务机关的严厉处罚，包括追缴税款、滞纳金和罚款，甚至可能构成犯罪，被追究刑事责任。
法律建议
劳动者方面：
- 如果发现公司发放阴阳工资，劳动者应首先与公司沟通，要求公司按照实际工资支付并补缴社保。如果公司拒绝改正，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
公司方面：
- 公司应严格遵守国家法律法规，按照实际工资支付劳动者报酬，并依法缴纳社保和个税。公司可以通过提高管理效率、优化薪酬结构等方式来降低成本，而不是通过发放阴阳工资等违法手段来损害劳动者权益和逃避法律责任。
综上所述，公司发放阴阳工资是违法的，不仅损害了劳动者的合法权益，也违反了国家的税收和劳动法规。如果遇到此类问题，劳动者应积极维护自己的权益，公司也应自觉遵守法律法规，共同营造一个公平、合法的劳动环境。如果你有更多关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。