在破产债权中，工程款并不当然优先于抵押权，但在特定情况下，建设工程价款优先受偿权会优于抵押权和其他债权。以下是对这一问题的详细分析：

一、抵押权的优先性基础

根据《中华人民共和国企业破产法》第一百零九条的规定：“对破产人的特定财产享有担保权的权利人，对该特定财产享有优先受偿的权利。”这一条款明确赋予了抵押权人在破产程序中的优先受偿权。抵押权作为一种物权，其核心特性就是优先性，即抵押权人有权在债务人不履行债务时，就抵押物优先于其他债权人受偿。

二、工程款优先受偿权的特殊规定

然而，在建设工程领域，存在一种特殊的优先受偿权，即建设工程价款优先受偿权。根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第三十六条的规定：“承包人享有的建设工程价款优先受偿权优于抵押权和其他债权。”这意味着，在建设工程领域，如果承包人未按照合同约定获得工程款，其有权就建设工程折价或者拍卖的价款优先受偿，且这种优先受偿权优先于抵押权和其他债权。

三、抵押权与工程款优先受偿权的冲突与协调

1. 冲突表现：

   • 当破产企业的财产同时存在抵押权和建设工程价款优先受偿权时，两者在受偿顺序上会产生冲突。抵押权人希望按照抵押权的优先性受偿，而承包人则希望按照建设工程价款优先受偿权的规定优先受偿。

2. 协调原则：

   • 在处理这种冲突时，应遵循法律规定的优先顺序。即首先满足建设工程价款优先受偿权的需求，如果建设工程价款优先受偿权得到全额满足后仍有剩余财产，再按照抵押权的优先性进行受偿。
   • 如果抵押物的价值不足以同时满足抵押权和建设工程价款优先受偿权的需求，那么应按照法律规定的优先顺序进行分配，即建设工程价款优先受偿权优先于抵押权受偿。

四、实际操作中的注意事项

1. 审查合同与登记情况：

   • 在处理涉及抵押权和建设工程价款优先受偿权的破产案件时，应仔细审查相关合同和登记情况，以确定抵押权和建设工程价款优先受偿权的设立是否合法有效。

2. 评估抵押物价值：

   • 对抵押物的价值进行评估，以确定其是否足以清偿抵押权和建设工程价款优先受偿权。如果抵押物价值不足，应按照法律规定的优先顺序进行分配。

3. 协商与调解：

   • 在可能的情况下，可以尝试通过协商和调解的方式解决抵押权人和承包人之间的冲突，以达成双方都能接受的解决方案。

总结来说，在破产债权中，工程款并不当然优先于抵押权，但在特定情况下（如建设工程价款优先受偿权），工程款会优先于抵押权受偿。因此，在处理涉及抵押权和工程款的破产案件时，应仔细审查相关法律法规和合同条款，以确定各种债权的优先顺序，并确保各方权益得到公正合理的保护。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。