结论：车主将车辆挂靠到物流公司时，无法通过签订一份协议就完全免除在车祸事故中的所有责任。但可以通过合理的协议安排，在特定条件下减轻或明确责任划分。以下从不同角度进行分析：
一、挂靠协议的法律性质与责任划分
挂靠协议的法律基础：
- 挂靠协议是车主与物流公司之间就车辆使用、管理、收益等事项达成的协议。虽然协议内容可以双方约定，但必须遵守法律法规的强制性规定。
责任划分原则：
- 在交通事故中，责任划分主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关司法解释。根据这些规定，交通事故责任通常根据事故当事人的过错程度来确定。
- 挂靠协议不能完全免除车主或物流公司的法定责任。例如，如果车主或物流公司存在过错（如车辆未年检、驾驶员无证驾驶等），则仍需承担相应的法律责任。
二、协议中可约定的责任减轻或免除条款
明确管理责任：
- 协议中可以明确物流公司对车辆的管理责任，如定期检查车辆状况、确保驾驶员资质等。如果物流公司未履行这些管理责任，导致事故发生，则物流公司应承担相应责任。
- 同时，车主也应明确自己在车辆使用、维护等方面的责任，以减轻在事故中的潜在责任。
约定保险事宜：
- 协议中可以约定车辆保险的购买、理赔等事宜。确保车辆购买了足够的保险，以便在事故发生时能够获得足够的赔偿。
- 可以约定在事故发生后，由保险公司先行赔付，不足部分再根据协议约定由双方分担。
约定责任分担比例：
- 在协议中，双方可以协商约定在特定情况下（如非双方过错导致的事故）的责任分担比例。但这种约定必须合法合理，且不能完全免除一方的法定责任。
三、实际操作中的注意事项
协议内容合法合规：
- 协议内容必须遵守法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗。否则，协议中的相关条款可能被认定为无效。
明确协议目的和范围：
- 协议应明确双方的目的和合作范围，避免模糊不清导致后续纠纷。例如，明确车辆的使用范围、挂靠期限等。
保留相关证据：
- 在签订协议和履行协议过程中，双方应保留相关证据（如协议文本、付款记录、车辆检查记录等），以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。
四、法律后果与风险提示
法律后果：
- 如果协议内容违法或不合理，可能导致协议无效或部分无效。在事故发生时，双方可能无法依据协议来划分责任，而需要依据法律法规来确定。
风险提示：
- 车主应认识到，即使签订了挂靠协议，也不能完全免除在事故中的法律责任。特别是当车主或物流公司存在过错时，仍需承担相应的法律责任。
- 因此，车主在选择挂靠物流公司时，应谨慎选择合作伙伴，确保对方具有良好的信誉和管理能力。同时，车主也应加强自身对车辆的管理和维护，降低事故风险。
总结与建议：车主将车辆挂靠到物流公司时，无法通过一份协议就完全免除在车祸事故中的所有责任。但可以通过合理的协议安排来明确双方的责任划分和分担比例。在签订协议时，应确保协议内容合法合规、明确具体，并保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。