医疗机构未经批准擅自售卖自制膏药，将面临行政处罚，情节严重的可能涉及刑事处罚，具体处罚需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 行政处罚角度

根据《中华人民共和国药品管理法》的相关规定，医疗机构若要配制制剂（包括膏药等），必须取得《医疗机构制剂许可证》，并且制剂需经省级药品监督管理部门批准，取得制剂批准文号。若医疗机构未取得相关许可和批准，擅自配制并售卖膏药，将面临以下行政处罚：

• 没收违法所得：药品监督管理部门将没收医疗机构因售卖自制膏药所获得的全部违法收入。
• 罚款：根据违法情节的严重程度，医疗机构可能面临货值金额一定倍数的罚款，罚款倍数通常在十倍至二十倍之间；若货值金额不足十万元的，则按十万元计算罚款。
• 情节严重时的处罚：若医疗机构的违法行为情节严重，其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能面临十年内禁止从事药品生产经营活动的处罚，医疗机构也可能被吊销《医疗机构制剂许可证》或相应的药品批准证明文件。

1. 刑事处罚角度

若医疗机构售卖的自制膏药存在质量问题，如成分不符、含有有害物质等，且造成了严重后果（如患者健康受损、死亡等），则可能构成生产、销售劣药罪或生产、销售假药罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，医疗机构及相关责任人员可能面临有期徒刑、无期徒刑甚至死刑的刑事处罚，并可能并处罚金或没收财产。

1. 其他法律责任

除了行政处罚和刑事处罚外，医疗机构还可能因售卖自制膏药而承担民事赔偿责任。若患者因使用自制膏药而遭受损害，医疗机构需根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，承担相应的赔偿责任。

建议：医疗机构应严格遵守相关法律法规，确保所有药品的配制和售卖均经过合法审批和许可。若您在医疗机构管理或药品监管方面遇到法律问题，欢迎直接向我咨询。