核心结论：车贷逾期后还了本金，但银行卡仍被扣利息加利息，可按以下步骤处理：先核查合同条款，确认利息计算方式；再与贷款方沟通协商；若协商无果，可向监管部门投诉或通过法律途径解决。以下是具体情况分析：

1. 核查贷款合同条款
   • 确认利息计算方式：仔细查看车贷合同中关于利息、罚息、复利等费用的计算方式和收取标准。有些贷款合同可能会约定在逾期情况下，除了正常利息外，还会收取一定比例的罚息，甚至可能存在复利计算的情况。例如，合同可能规定逾期罚息为正常利率的 1.5 倍，或者对未按时支付的利息按一定利率计收复利。如果合同中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么贷款方按照合同约定收取利息加利息可能是合法的。
   • 检查是否有额外费用条款：除了利息相关费用，还要查看合同中是否还有其他可能产生费用的条款，如手续费、违约金等。有时候贷款方可能会将这些费用与利息一起收取，导致实际还款金额超出预期。如果发现合同中存在不合理或不明确的费用条款，这可能成为后续协商或维权的依据。
2. 与贷款方沟通协商
   • 说明还款情况：主动联系贷款方，如银行或汽车金融公司，向其说明自己已经偿还了本金的情况，并询问为何仍被扣除利息加利息。要求贷款方提供详细的费用明细，包括每笔费用的计算依据和收取时间。通过与贷款方的沟通，可以更清楚地了解费用产生的原因，避免因信息不对称而产生误解。
   • 协商减免不合理费用：如果认为贷款方收取的利息加利息存在不合理之处，如罚息过高、复利计算方式不合法等，可以与贷款方协商减免部分费用。在协商过程中，要保持冷静和理性，以合同条款和法律法规为依据，提出合理的诉求。例如，可以引用相关法律规定，说明罚息利率不得超过法定上限，要求贷款方对超出部分予以减免。
3. 向监管部门投诉
   • 确定投诉对象和渠道：如果与贷款方协商无果，可以向相关的监管部门投诉。如果是银行贷款，可以向当地的中国银行保险监督管理委员会（银保监会）投诉；如果是汽车金融公司贷款，可以向当地的金融监管局投诉。可以通过拨打监管部门的投诉热线、登录其官方网站或前往其办公地点等方式进行投诉。
   • 准备投诉材料：在投诉时，要准备好相关的证据材料，如贷款合同、还款凭证、与贷款方的沟通记录等。这些材料可以证明自己的还款情况和贷款方的不合理收费行为，有助于监管部门进行调查和处理。
4. 通过法律途径解决
   • 咨询律师意见：如果问题仍然无法解决，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。可以咨询专业律师，向律师详细描述自己的情况，并提供相关证据材料。律师会根据具体情况进行分析和评估，为你提供专业的法律建议和解决方案。
   • 提起诉讼或申请仲裁：根据律师的建议，如果认为贷款方的行为构成违约或侵权，可以向法院提起诉讼或根据合同约定申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，要积极配合律师的工作，提供必要的证据和协助，以争取维护自己的合法权益。