招标代理公司支付给业主代表的酬劳能否收取，需分情况讨论，关键在于酬劳的性质及是否符合法律法规和行业规范。以下从不同角度进行分析：
一、合法合规的酬劳支付
合同约定：
- 如果招标代理公司与业主之间有明确的合同约定，且合同中规定了业主代表可以获取一定酬劳，同时该酬劳的支付方式、金额等均符合法律法规和行业规范，那么业主代表收取酬劳是合法的。
行业惯例：
- 在某些行业或地区，可能存在招标代理公司向业主代表支付一定酬劳的惯例。如果这种惯例不违反法律法规，且双方均认可，那么业主代表收取酬劳也是可以的。但需注意，行业惯例不能作为违反法律法规的借口。
二、非法或不合规的酬劳支付
贿赂性质：
- 如果招标代理公司支付给业主代表的酬劳实际上是一种贿赂，旨在影响业主代表在招标过程中的决策，使其偏向于招标代理公司或特定投标人，那么这种酬劳是违法的。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，行贿和受贿均可能构成犯罪，将受到法律的制裁。
违反招投标法规：
- 招投标活动应遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。如果招标代理公司通过支付酬劳的方式干扰招投标活动的正常进行，破坏了这些原则，那么这种行为也是违法的。根据《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，招标代理机构不得在所代理的招标项目中投标或者代理投标，也不得为所代理的招标项目的投标人提供咨询。如果支付酬劳被视为提供咨询或干扰招投标的一种形式，那么将受到法律的处罚。
未披露或隐瞒酬劳：
- 如果招标代理公司在招标过程中未披露或隐瞒向业主代表支付酬劳的情况，导致招投标活动失去透明度，损害了其他投标人的利益，那么这种行为也是不合规的。根据相关法律法规和行业规范，招投标活动应保持高度透明，所有相关信息均应公开披露。
三、法律建议
对于招标代理公司：
- 应严格遵守法律法规和行业规范，确保招投标活动的公开、公平、公正和诚实信用。
- 避免向业主代表支付任何可能被视为贿赂或干扰招投标活动的酬劳。
- 如果确实需要向业主代表支付酬劳（如因提供额外服务而产生的合理费用），应确保该酬劳的支付方式、金额等均符合法律法规和行业规范，并在合同中明确约定。
对于业主代表：
- 应保持廉洁自律，避免接受任何可能影响公正决策的酬劳。
- 如果确实收到招标代理公司支付的酬劳，应仔细审查其性质和合法性，并咨询专业律师的意见。
- 如发现招标代理公司存在违法违规行为，应及时向相关部门举报。
总结来说，招标代理公司支付给业主代表的酬劳能否收取，取决于酬劳的性质及是否符合法律法规和行业规范。如果酬劳是合法合规的，且双方均认可，那么可以收取；但如果酬劳具有贿赂性质、违反招投标法规或未披露/隐瞒酬劳等情况，则不能收取，并可能面临法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。