公务员若违反保密规定，其处理方式主要依据相关法律法规进行，具体处理措施会根据违规行为的性质、情节严重程度以及造成的后果来综合判定。以下是对此问题的详细解答：

首先，根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》的相关规定，公务员若泄露国家秘密、工作秘密，或者泄露因履行职责掌握的商业秘密、个人隐私，且造成不良后果或者影响的，将会受到相应的政务处分。这些处分包括警告、记过、记大过，对于情节较重的，可能会予以降级或者撤职，而对于情节严重的，甚至可能予以开除。

其次，如果公务员的泄露行为构成犯罪，即故意泄露国家秘密罪，那么将依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行刑事处罚。根据刑法第三百九十八条，国家机关工作人员违反保守国家秘密法的规定，故意或者过失泄露国家秘密，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。对于非国家机关工作人员犯此罪的，也会依照前款的规定酌情处罚。

以您提供的案例为例，90后博士杨某作为新录用公务员，在入职仅一个月的时间内，就因故意泄露国家秘密被判处有期徒刑一年零二个月。这一案例充分说明了公务员违反保密规定的严重性，以及法律对此类行为的严厉打击。

因此，作为公务员，必须严格遵守保密规定，不得泄露任何国家秘密、工作秘密以及因履行职责掌握的商业秘密和个人隐私。一旦违反，不仅将面临政务处分，还可能承担刑事责任，给个人和国家带来难以挽回的损失。

总的来说，公务员违反保密规定的处理方式包括政务处分和刑事处罚两种，具体处理措施会根据违规行为的性质、情节严重程度以及造成的后果来综合判定。希望所有公务员都能严格遵守保密规定，共同维护国家的安全和稳定。