当分公司与总公司不在一个城市时，若需起诉，一般应向分公司所在地的法院提起诉讼，但具体还需根据诉讼主体和诉讼标的来确定管辖法院。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、诉讼主体角度
若以分公司为被告：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。分公司作为总公司的分支机构，虽然不具有独立的法人资格，但有其独立的住所地（即经营场所）。
- 因此，若以分公司为被告，应向分公司所在地的法院提起诉讼。
若以总公司为被告：
- 同样根据《中华人民共和国民事诉讼法》，对法人提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。总公司的住所地是其主要办事机构所在地。
- 若以总公司为被告，且分公司与总公司不在同一城市，则应向总公司所在地的法院提起诉讼。但需注意，若分公司也参与了相关法律行为或纠纷，且该行为或纠纷与分公司有直接关联，法院可能会根据案件具体情况，考虑将分公司也列为共同被告或第三人，此时可能涉及多个法院的管辖问题，但通常仍以总公司住所地法院为主要管辖法院，除非有特别规定或协议管辖。
若同时起诉分公司和总公司：
- 在这种情况下，由于分公司和总公司分别位于不同城市，理论上可能存在两个法院都有管辖权的情况。但根据《中华人民共和国民事诉讼法》的“原告就被告”原则，以及避免诉讼资源浪费和裁判冲突的考虑，通常会由总公司所在地的法院管辖，或者根据案件具体情况和法院之间的协商，确定一个最合适的管辖法院。不过，若分公司和总公司之间的法律关系清晰，且纠纷主要与分公司相关，分公司所在地的法院也可能成为管辖法院。
二、诉讼标的角度
- 诉讼标的即当事人之间发生争议并要求法院作出裁判的民事权利义务关系。若诉讼标的与分公司直接相关（如分公司签订的合同纠纷、分公司侵权等），则更倾向于由分公司所在地的法院管辖。
- 若诉讼标的与总公司直接相关，或涉及分公司和总公司之间的内部关系（如总公司对分公司的管理、决策等），则可能由总公司所在地的法院管辖。
三、特殊情况与协议管辖
- 特殊情况：如法律、司法解释对特定类型的纠纷有特别规定管辖法院的（如不动产纠纷由不动产所在地法院管辖），则应遵循这些特别规定。
- 协议管辖：若分公司与总公司之间，或分公司与第三方之间在合同中约定了管辖法院，且该约定符合法律规定的（如不违反级别管辖和专属管辖的规定），则应按照约定确定管辖法院。
法律建议
- 在提起诉讼前，应仔细分析诉讼主体和诉讼标的，确定最合适的管辖法院。
- 若对管辖法院有疑问或不确定，建议咨询专业律师，以获取更准确的法律意见。
- 在准备诉讼材料时，应确保包含所有与管辖法院相关的证据和信息，如分公司的营业执照、住所地证明、合同等。
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