针对您提出的“土地纠纷有土地确权证是否可以直接法院起诉”的问题，结论前置如下：

1. 若纠纷属于平等主体间的民事权益争议，如土地承包经营权或土地使用权转让纠纷，且不涉及土地所有权和使用权的归属问题，您可以直接向人民法院提起民事诉讼。
2. 若纠纷涉及土地所有权和使用权的归属问题，即使您持有土地确权证，也不能直接向法院起诉，而应先由人民政府进行处理。对处理结果不服时，您可以在接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院提起行政诉讼。

详细分析如下：

一、可直接向人民法院起诉的情况

当土地纠纷属于平等主体之间的民事权益争议时，您可以直接向人民法院提起民事诉讼。这类纠纷通常涉及土地承包经营权、土地使用权转让等民事权益的争议。例如，如果您与他人就土地承包经营权的流转、继承等问题产生争议，或者因土地使用权转让合同的效力、履行等存在分歧，您都有权直接向法院提起诉讼，要求对方承担相应的民事责任。

二、需先经过行政处理再起诉的情况

对于涉及土地所有权和使用权归属问题的纠纷，根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，您应先尝试与对方协商解决。协商无果后，应由人民政府进行处理。具体处理流程如下：

• 单位之间的争议：由县级以上人民政府负责处理。
• 个人之间、个人与单位之间的争议：由乡级人民政府或者县级以上人民政府负责处理。

在人民政府对纠纷作出处理决定后，如果您对该决定不服，可以在接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院提起行政诉讼。此时，诉讼的被告是作出处理决定的人民政府，诉讼的目的是审查政府作出的土地确权处理决定是否合法。

三、起诉时的注意事项

在提起土地纠纷诉讼时，您应准备充分的证据材料以支持自己的主张。这些证据可能包括土地确权证、土地承包合同、土地使用权转让合同、相关政府部门的处理决定等。证据的充分性和有效性对于诉讼的成功至关重要。

四、具体案例说明

假设您与邻居就一块宅基地的使用权产生争议，且您持有该宅基地的确权证。在这种情况下，您不能直接向法院起诉邻居侵犯您的宅基地使用权，而应先尝试与邻居协商解决。协商无果后，您应向乡级人民政府或县级以上人民政府申请处理。如果政府最终将宅基地确权给您，但邻居仍不认可并继续占用，您可以在接到政府处理决定通知之日起三十日内，向人民法院提起行政诉讼，要求法院确认政府的确权决定合法并责令邻居停止侵权行为。

总结与建议：

土地纠纷的起诉与处理方式因纠纷性质而异。在处理此类纠纷时，建议您首先明确纠纷的性质，然后依据相关法律法规选择适当的解决途径。如果您对土地纠纷的处理流程或法律条款存在疑问，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的实际情况提供准确的法律指导和建议。