工厂自离时，劳动者有权获得其已提供劳动部分的工资，工厂不得以自离为由拒绝支付工资。这一结论主要基于以下法律分析和实际情况考虑：

法律依据与解析

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：

   • 法条内容：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 具体解释：此条款明确了劳动者获得劳动报酬的基本权利。无论劳动者是正常离职还是自行离职（自离），只要提供了劳动，用人单位就必须按照约定支付相应的工资。自离作为离职的一种方式，并不影响劳动者对已完成工作部分应得报酬的主张。

2. 《工资支付暂行规定》第九条：

   • 法条内容：劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
   • 具体解释：此规定确保了劳动者在离职时能够及时、足额地收到应得的工资，无论是正常离职还是自离。工厂作为用人单位，有义务在劳动者离职时一次性付清其工资。

3. 《中华人民共和国劳动合同法》相关规定：

   • 补充解释：该法律进一步强调了劳动者在付出劳动后应获得报酬的权利。即使劳动者选择自行离职，对于已经实际付出的劳动部分，工厂也负有支付工资的义务。

特殊情况处理

• 经济损失赔偿：
  • 如果劳动者自离确实给工厂造成了实际经济损失，如项目延期、客户流失等，工厂可以依据劳动合同约定或法律规定要求劳动者赔偿损失。但需注意，赔偿金额受到一定限制，如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
  • 关键点：赔偿与工资支付是两个独立的法律关系。工厂不能直接用工资来抵扣损失，必须通过合法途径，如协商或通过劳动争议仲裁等方式来解决赔偿问题。

劳动者权益与应对措施

• 劳动报酬权：

  • 劳动者在付出劳动后，无论离职原因如何，均有权获得应得的劳动报酬。这是劳动者的基本权益，受法律保护。

• 维权途径：

  • 若工厂以自离为由拒绝支付工资，劳动者可以通过以下合法途径维护自己的权益：
    1. 协商：首先尝试与工厂进行友好协商，要求其支付工资。
    2. 投诉：向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令工厂限期支付工资。
    3. 仲裁：若协商和投诉均无果，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求工厂支付工资及可能产生的赔偿金等。

实际操作建议

• 劳动者在自离前，应尽可能与工厂沟通好离职事宜，包括工资结算等，以避免不必要的纠纷。
• 若工厂拒绝支付工资，劳动者应保留好相关证据，如工作记录、工资条等，以便在维权时提供有力支持。

综上所述，工厂自离时劳动者有权获得工资，这是由多部法律法规共同保障的基本权利。工厂应严格遵守相关法律规定，确保劳动者的合法权益得到充分保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。