核心结论：在工作中造成4万元损失的赔偿问题，需根据具体情况判断责任归属及赔偿范围，一般需结合过错程度、合同约定、公司制度及法律规定综合确定。以下分情况说明：

1. 若因个人故意或重大过失造成损失

   • 责任归属：根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应承担侵权责任。若员工因故意或重大过失（如违规操作、疏忽大意等）导致公司损失，公司有权要求赔偿。
     
   • 赔偿范围：通常以实际损失为限（即4万元），但需扣除公司已通过保险、第三方追偿等方式弥补的部分。若员工能证明损失部分与其行为无直接因果关系（如市场波动、不可抗力等），可主张减免责任。
     
   • 例外情形：若公司规章制度或劳动合同中明确约定“损失全额赔偿”且不违反法律强制性规定（如未超出员工月工资的20%），员工可能需全额赔偿；但若约定显失公平（如要求员工承担超出其经济能力的赔偿），法院可能调整赔偿金额。

2. 若因一般过失或无过错造成损失

   • 责任归属：根据《工资支付暂行规定》第16条，仅在员工因本人原因给公司造成经济损失时，公司可按劳动合同约定要求赔偿，且每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%。若损失非因员工故意或重大过失导致（如正常业务风险、设备故障等），员工通常无需赔偿。
     
   • 赔偿范围：即使需赔偿，公司也需证明损失与员工行为的直接因果关系，且赔偿金额不得超过员工经济承受能力。例如，若员工月工资5000元，公司每月最多扣除1000元作为赔偿，直至扣完4万元或员工离职。

3. 公司制度与合同约定的影响

   • 若公司规章制度或劳动合同中已明确损失赔偿规则（如“因违规操作导致损失的，按损失金额的50%赔偿”），且该规则经民主程序制定并公示，员工需遵守约定，但赔偿比例仍需合理（如不超过实际损失的合理范围）。
     
   • 若公司未提前告知赔偿规则，或规则违反法律强制性规定（如要求员工承担无限连带责任），员工可主张规则无效，拒绝不合理赔偿。

建议行动：

• 员工角度：首先核对劳动合同、公司制度中关于损失赔偿的条款；其次收集证据证明自身过错程度（如操作记录、培训记录等）；最后与公司协商赔偿方案，必要时通过劳动仲裁或诉讼维护权益。
  
• 公司角度：需证明损失与员工行为的直接因果关系，且赔偿规则合法合理；避免采取扣发工资、停职等非法手段追偿，否则可能面临行政处罚或员工索赔。

如有进一步细节（如损失原因、合同条款等），可向我补充说明，我会为您具体分析。