在处理聚众斗殴案件时，如果面临没有足够证据或涉案人员未全部抓捕归案的情况，司法机关会遵循一套严谨且公正的程序来确保案件得到妥善处理。以下是对这一问题的详细解答：
一、侦查阶段
持续追捕与侦查：
- 公安机关会不遗余力地追捕在逃的犯罪嫌疑人，采用多种侦查手段，如发布通缉令、调查社会关系、追踪手机定位等，以尽快将其缉拿归案。
- 同时，公安机关会向可能藏匿的地区发布协查通报，请求当地公安机关的协助，形成全国范围内的追捕网络。
对已抓获人员的处理：
- 对于已经抓获的犯罪嫌疑人，公安机关会依法进行讯问，详细了解案件情况，并收集相关证据。
- 如果证据充分，能够证明犯罪事实，公安机关会按照法定程序将案件移送人民检察院审查起诉。
- 在讯问过程中，已抓获人员的供述与其他证据（如监控录像、证人证言等）需要相互印证，以形成完整的证据链。
证据固定和补充：
- 公安机关会进一步收集和固定与案件相关的各种证据，包括现场勘查笔录、物证、证人证言等，以确保案件事实的清晰和证据的充分。
- 同时，公安机关会关注已抓获人员提供的关于在逃人员的线索，以完善证据链条，为后续的追捕和审判工作提供有力支持。
二、审查起诉阶段
对已抓获人员的起诉：
- 人民检察院在收到公安机关移送的案件后，会对已抓获人员的犯罪事实和证据进行全面审查。
- 如果认为犯罪事实清楚，证据确实、充分，人民检察院将依法对已到案的犯罪嫌疑人提起公诉，要求法院对其进行审判。
对在逃人员的处理：
- 对于在逃的犯罪嫌疑人，人民检察院会要求公安机关继续追捕，并确保在追捕过程中不遗漏任何重要线索。
- 在必要时，人民检察院也可以自行补充侦查与在逃人员有关的证据，以确保案件的完整性和公正性。
- 如果发现新证据指向在逃人员的犯罪行为，人民检察院会及时与公安机关沟通，督促其加大追捕力度。
三、审判阶段
对已抓获人员的审判：
- 法院会对已被提起公诉的犯罪嫌疑人进行审判，根据查明的事实和证据依法作出判决。
- 即使部分嫌疑人在逃，也不影响对已到案人员的定罪量刑。法院会依据现有证据和法律规定，对已到案人员作出公正的判决。
在逃人员归案后的处理：
- 如果在逃人员在案件审理过程中或判决生效后被抓获，司法机关将对其单独进行侦查、审查起诉和审判。
- 在审判时，法院会考虑其在聚众斗殴中的具体行为和情节，依法作出判决，并参考之前已审结案件的情况，确保量刑的平衡和公正。
总结与建议
聚众斗殴案件中，即使涉案人员未全部抓捕归案或证据不够充分，司法机关也会根据已有证据和事实依法进行处理。对于已到案人员，将依法进行侦查、起诉和审判；对于在逃人员，将继续追捕并确保其最终受到法律制裁。
如果您或他人涉及此类案件，建议积极配合司法机关的调查工作，提供真实、准确的线索和证据，以协助司法机关尽快查明案件事实，维护社会的公正和稳定。同时，也请相信我国法律体系的严谨性和公正性，以及司法机关打击犯罪、维护社会稳定的决心和能力。