针对因燃气危险作业罪被罚款5万元的情况，核心处理步骤如下，您可根据实际情况选择适用方向：

1. 确认处罚主体与程序合法性
   首先需核实处罚主体是否为具有行政处罚权的燃气管理部门或应急管理部门，并检查《行政处罚决定书》是否载明违法事实、法律依据（如《刑法》第一百三十四条之一或《安全生产法》相关条款）、处罚金额计算方式及救济途径。若存在主体不适格、程序违法（如未告知听证权利）或事实认定错误，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

2. 评估违法情节与处罚合理性
   根据《刑法》第一百三十四条之一，燃气危险作业罪需满足”涉及安全生产的事项未经依法批准或许可，擅自从事危险作业”且”具有发生重大伤亡事故或其他严重后果的现实危险”要件。若行政机关将一般违法行为升格为刑事犯罪标准处罚，或罚款金额超出《安全生产法》第一百零一条规定的”十万元以下”幅度，可主张处罚显失公正，要求调整。

3. 分情形处理方案

   • 若认可处罚：需在收到决定书15日内缴纳罚款（逾期每日按3%加处罚款），同时整改安全隐患并提交书面整改报告，避免后续刑事追责。
     
   • 若申请复议：需在60日内向同级人民政府或上级主管部门提交复议申请，附证据证明处罚程序违法或事实不清（如作业设备符合安全标准、已采取防护措施等）。
     
   • 若提起诉讼：需在6个月内向法院起诉，重点论证行政机关未履行调查取证义务、适用法律错误或处罚明显不当，可申请法院撤销或变更处罚决定。

4. 刑事风险防范
   若行政处罚中发现涉嫌犯罪线索（如多次违规、造成实际危害后果），行政机关可能将案件移送公安机关。此时需立即委托律师介入，从主观故意程度、危害后果可控性、整改措施有效性等角度争取不立案或取保候审。

特别提醒：燃气危险作业罪系行为犯，即使未发生实际事故，只要存在现实危险即可构成犯罪。建议企业立即完善安全管理制度、组织员工培训、配备合规设备，并定期邀请第三方机构进行安全评估，从源头降低法律风险。如有具体案情需要分析，可直接向我提供更多细节。