应急管理部门对危险作业罪的处罚主要体现为行政处罚，但需注意危险作业罪本身是刑事犯罪，最终处罚可能涉及行政与刑事双重责任。具体分析如下：

1. 行政处罚层面
   根据《安全生产法》《危险化学品安全管理条例》等法律法规，应急管理部门对存在危险作业行为（如拒不整改重大事故隐患、未经批准擅自从事高危作业等）的企业或个人，可采取以下行政处罚措施：

   • 责令限期改正：要求立即停止违法行为，消除事故隐患；
     
   • 罚款：对单位可处20万元以下罚款（情节严重可更高），对个人可处上一年年收入30%-100%的罚款；
     
   • 暂扣或吊销许可证：如安全生产许可证、经营许可证等；
     
   • 责令停产停业整顿：对存在重大隐患且拒不整改的企业，可强制停产；
     
   • 列入“黑名单”：对严重违法企业实施联合惩戒，限制其市场准入。

2. 刑事处罚层面（危险作业罪）
   若行为符合《刑法》第134条之一规定的危险作业罪构成要件（如涉及生产、作业中违反安全管理规定，具有发生重大伤亡事故或其他严重后果的现实危险），应急管理部门会将案件移送公安机关立案侦查，最终由法院判处：

   • 有期徒刑或拘役：一般处1年以下有期徒刑、拘役或者管制；
     
   • 并处罚金：可并处或单处罚金；
     
   • 行业禁入：对直接负责的主管人员和其他责任人员，可能禁止其在一定期限内从事相关职业。

3. 行政与刑事处罚的衔接

   • “行刑衔接”机制：应急管理部门在行政执法中发现涉嫌犯罪的，会及时将案件移送公安机关，避免“以罚代刑”；
     
   • 处罚竞合处理：若行为同时构成行政违法和刑事犯罪，行政处罚与刑事处罚可并行（如罚款与罚金不冲突，但拘留与拘役可能折抵）；
     
   • 企业责任与个人责任分离：企业被行政处罚不影响对直接责任人的刑事追责，反之亦然。

建议：若您或企业涉及危险作业行为，需立即停止违法行为，配合应急管理部门调查，并主动整改隐患。若已收到行政处罚决定或面临刑事调查，可进一步向我咨询具体应对策略（如行政复议、刑事辩护等）。