结论前置：车祸致人死亡且负主责的情况下，即使家属出具谅解书，行为人通常仍会有案底；但在特定情节下，可能不起诉或免予刑事处罚，从而不留下案底。

详细分析：

1. 构成犯罪的情况：

   • 一般会有案底：根据《中华人民共和国刑法（2023修正）》第一百三十三条，违反交通运输管理法规，发生重大事故致人死亡，且负事故主要责任或全部责任的，构成交通肇事罪。一旦被认定为有罪，通常会留下案底。谅解书在量刑时可能作为从轻处罚的情节考虑，但并不改变犯罪事实的认定和案底的存在。例如，张三因疏忽大意发生交通事故致一人死亡，并负主要责任，虽积极赔偿并取得谅解书，但仍会因犯罪行为留下案底。
   • 特殊情况可能不起诉或免予刑事处罚：对于一些情节较轻的交通肇事案件，如果肇事者具有自首、立功、积极赔偿并取得谅解等从轻、减轻情节，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十五条，检察院可能会认为犯罪情节轻微，作出不起诉决定，或者法院可能会判决免予刑事处罚。在这种情况下，可能不会留下案底。例如，李四开车时不小心撞死人，但事后立即停车报警、积极救助伤者、主动赔偿并取得谅解书，且综合考虑事故具体情况后，检察院认为其犯罪情节轻微而决定不起诉，则李四可能不会有案底。

2. 不构成犯罪的情况：

   • 如果开车撞死人后，经交警部门认定，肇事者对事故不负主要责任或全部责任，那么该事件属于意外事件或民事纠纷范畴，不构成犯罪，因此不会有案底。例如，王五正常驾驶机动车时，行人赵六闯红灯闯入机动车道导致被撞死，且经交警部门认定王五对此次事故不负主要责任，则王五的行为不构成犯罪，不会留下案底。

法律建议：

• 严格遵守交通法规：驾驶者应严格遵守交通法规，确保行车安全，以避免可能的法律后果。
• 积极应对事故：一旦发生交通事故，应立即停车报警、积极救助伤者，并主动配合交警部门的调查和处理。
• 寻求法律帮助：如果涉及刑事责任，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果和辩护策略。

可能后果：

• 构成犯罪且留下案底：如果构成交通肇事罪且被法院判决有罪，将留下案底，这可能对未来的就业、出国等产生不利影响。
• 不构成犯罪或不起诉/免予刑事处罚：如果不构成犯罪或检察院决定不起诉/法院判决免予刑事处罚，则不会留下案底，对未来的影响相对较小。

综上所述，车祸致人死亡且负主责的情况下，即使家属出具谅解书，行为人通常仍会有案底；但在特定情节下，可能不起诉或免予刑事处罚，从而不留下案底。因此，驾驶者应严格遵守交通法规，确保行车安全，以避免可能的法律后果。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。