结论先行：面对上司要求你将多一天的工资发给他微信上的情况，为了留下证据，你可以采取以下策略进行沟通，并确保整个过程的合法性与证据的有效性。
一、沟通策略与证据留存
书面确认需求：
- 首先，通过微信、邮件或公司内部通讯工具等书面形式，向上司明确询问：“您是否要求我将多出的一天工资（具体金额）通过微信转账给您？请确认。”这样的询问既体现了你的谨慎，也为后续留存证据打下了基础。
转账时备注清晰：
- 在进行微信转账时，务必在转账备注中明确写明：“归还多发的XX日工资XX元”。这样的备注能够直接说明转账的性质和目的，避免未来可能出现的误解或纠纷。
保存转账记录与聊天记录：
- 转账完成后，务必保存好转账记录截图，包括转账金额、时间、备注信息等。同时，也保存好与上司的聊天记录，特别是关于此次转账的确认和沟通部分。这些记录将作为未来可能出现的法律纠纷中的重要证据。
二、法律背景与建议
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果上司要求你将多发的工资退回，从法律角度讲，这是合理的。但关键在于，整个过程需要合法、透明，并留存好相关证据。
避免私下交易：
- 尽管上司可能出于方便或信任的原因要求你通过微信转账，但为了避免未来可能出现的纠纷，建议尽量通过公司正规的财务流程进行退款。如果确实需要通过微信转账，也务必按照上述策略留存好证据。
保护个人权益：
- 在整个过程中，你要时刻保护好自己的个人权益。如果上司的要求让你感到不适或存在疑虑，你有权拒绝并向上级领导或公司人力资源部门反映情况。同时，也可以咨询我，获取更专业的法律建议。
三、可能后果与应对
如果未来出现纠纷：
- 如果你已经按照上述策略留存好了相关证据，那么在未来如果出现关于此次转账的纠纷时，你将能够提供有力的证据来支持自己的主张。这有助于维护你的合法权益，避免不必要的损失。
如果上司行为不当：
- 如果上司的行为让你感到被胁迫或存在其他不当行为，你有权向公司高层或相关部门举报。同时，也可以考虑寻求法律援助或咨询我，以获取更专业的帮助和支持。
最后，面对此类情况，保持冷静、谨慎并留存好相关证据是关键。如果你有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。