运输合同中约定承担修车费，这样的条款通常是有效的，但具体效力需结合合同内容、签订背景及法律规定综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同自由原则下的有效性
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议，依法成立的合同，受法律保护。在运输合同中，双方当事人有权自由约定合同的内容，包括修车费的承担方式。只要这种约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且是双方真实意思的表示，那么该约定就是有效的。
举例说明：如果运输合同中明确约定，在运输过程中因承运人原因导致车辆损坏的，由承运人承担修车费用，这样的条款是合法有效的。因为双方已经就修车费的承担达成了合意，且该约定不违反法律规定。
二、可能影响条款效力的因素
尽管合同自由原则赋予了当事人广泛的约定权利，但某些情况下，运输合同中关于修车费的约定可能会受到挑战或限制：
格式条款的效力：如果运输合同中的修车费承担条款是承运人为了重复使用而预先拟定，并在订立合同时未与托运人协商的格式条款，那么该条款可能受到《民法典》中关于格式条款规定的限制。特别是当该条款存在免除承运人责任、加重托运人责任或排除托运人主要权利的情形时，该条款可能被认定为无效。
显失公平的条款：如果运输合同中关于修车费的约定明显不公平，如要求托运人承担因承运人故意或重大过失导致的修车费用，这样的条款可能因显失公平而被撤销或变更。
违反法律强制性规定的条款：如果运输合同中的修车费承担条款违反了法律、行政法规的强制性规定，如要求托运人承担非法改装车辆的修车费用，这样的条款是无效的。
三、法律建议
明确约定：在签订运输合同时，双方应明确约定修车费的承担方式，包括修车费的范围、计算方式、支付时间等，以避免后续纠纷。
审查条款：托运人在签订运输合同前，应仔细审查合同中的修车费承担条款，确保该条款不违反法律规定，且对自己公平合理。
保留证据：在运输过程中，如果发生车辆损坏需要修车的情况，双方应保留好相关证据，如修车发票、维修记录等，以便在后续纠纷中证明自己的主张。
寻求法律帮助：如果双方在运输合同中关于修车费的承担产生纠纷，且无法协商解决，可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式解决纠纷。
总结来说，运输合同中约定承担修车费，在符合法律规定和双方真实意思表示的情况下是有效的。但双方在签订合同时应谨慎审查条款内容，确保条款的合法性和公平性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。