在车主与肇事司机不是同一人的情况下，赔偿责任主要由实际驾驶员承担，但车辆所有人在特定情形下也需承担相应责任。具体责任划分需依据双方的行为和过错情况来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、实际驾驶员的责任
根据《民法典》的相关规定，机动车使用人（即实际驾驶员）在驾驶过程中对车辆具有直接的控制和操作权。因此，当发生交通事故且属于机动车一方责任时，原则上由实际驾驶员承担赔偿责任。这是基于驾驶员作为实际控制者的行为直接决定了交通事故是否发生的事实。例如，若驾驶员因超速、酒驾等违法行为导致事故，那么驾驶员需承担全部或主要赔偿责任。
二、车辆所有人的责任
车辆所有人在以下特定情况下需承担赔偿责任：
过错责任：
- 若车辆所有人或管理人知道或应当知道机动车存在缺陷（如刹车失灵、轮胎磨损严重等）、驾驶人无驾驶资格、驾驶人饮酒或服用国家管制的精神药品等，却仍然将车辆交给其驾驶，导致交通事故发生的，车辆所有人或管理人需承担相应的赔偿责任。
特殊情形下的连带责任：
- 雇佣关系：若司机与车主是雇佣关系，且肇事时司机正在执行车主分派的任务，车主需承担赔偿责任。这是因为雇主对雇员在执行职务过程中的行为负有监督和管理责任。
- 挂靠关系：若以挂靠形式从事道路运输经营活动的机动车发生交通事故，挂靠人和被挂靠人需承担连带责任。这是因为挂靠关系使得被挂靠人在一定程度上对挂靠车辆享有管理权，因此需对挂靠车辆造成的损害承担连带责任。
- 车辆转让未过户：当事人之间已经以买卖或其他方式转让并交付机动车但未办理登记的，发生交通事故后，由受让人承担赔偿责任。若车辆多次转让均未办理过户手续，由最后一次转让并交付的受让人承担责任。但若原车主对事故发生存在过错（如未告知车辆缺陷等），也可能需承担相应责任。
- 车辆被盗抢：盗窃、抢劫或抢夺的机动车发生交通事故的，由盗窃人、抢劫人或抢夺人承担赔偿责任。若盗窃人、抢劫人或抢夺人与机动车使用人不是同一人，且属于机动车一方责任的，两者需承担连带责任。保险公司在机动车强制保险责任限额范围内垫付抢救费用的，有权向交通事故责任人追偿。
- 未经允许驾驶：未经车辆所有人同意，私自开车发生交通事故的，由肇事司机承担赔偿责任。但车辆所有人若对机动车被非法使用有过错（如未妥善保管车钥匙），也需承担相应的赔偿责任。
三、具体情形下的责任划分
租赁、借用关系：
- 因租赁、借用等情形导致车主与使用人不是同一人时，发生交通事故的，由机动车使用人承担赔偿责任；机动车所有人、管理人对损害的发生有过错的（如明知车辆有缺陷仍出租、借出），承担相应的赔偿责任。
转让拼装或报废车辆：
- 根据《民法典》的相关规定，转让人和受让人对交通事故造成的损害承担连带责任。这是因为拼装或报废车辆本身存在严重的安全隐患，转让人和受让人均应对此承担责任。
四、总结与建议
在车主与肇事司机不是同一人的交通事故中，赔偿责任的承担需综合考虑实际驾驶员和车辆所有人的行为和过错情况。受害人应根据具体情况选择合适的追偿对象，并在必要时寻求法律专业人士的帮助以确保自身权益得到妥善维护。同时，车辆所有人也应加强车辆管理，避免将车辆交给无驾驶资格或存在其他安全隐患的人员使用，以减少潜在的法律风险。
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