在民法典的框架下，违约并不能直接扣除全部货款，这一行为是否合法需依据具体情形判断。以下是对此问题的详细分析：
一、违约与货款扣除的基本原则
在货物买卖合同中，违约是指一方未按照合同约定履行其义务。货款是买方因购买货物而应支付给卖方的金钱。违约与货款扣除之间的关系，并非简单的“违约即可扣除全部货款”。实际上，违约的处理方式需依据合同约定、违约性质及法律规定来确定。
二、违约的处理方式
继续履行：如果违约方能够继续履行合同，且继续履行对守约方有意义，那么守约方可以要求违约方继续履行合同，而不是直接扣除货款。
采取补救措施：如果违约导致货物存在质量问题或不符合合同约定，违约方可以采取修理、更换、重作、退货、减少价款或者报酬等补救措施。在这种情况下，货款可能会根据补救措施的结果进行相应调整，但并非直接扣除全部货款。
赔偿损失：如果违约给守约方造成了损失，违约方应当赔偿守约方因此所遭受的损失。赔偿损失的范围通常包括实际损失和可得利益损失，但并不意味着可以直接扣除全部货款作为赔偿。
三、货款扣除的合法情形
在特定情况下，货款可能会被扣除或抵销，但这通常需要满足以下条件：
双方约定：如果合同中明确约定了在违约情况下可以扣除货款作为违约金或赔偿，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这种扣除是合法的。
法定抵销：根据《中华人民共和国民法典》第五百六十八条的规定，如果双方互负债务且债务的标的物种类、品质相同，任何一方可以将自己的债务与对方的到期债务抵销。然而，这并不意味着可以直接扣除全部货款，而是需要在双方债务均到期且符合其他法定条件的情况下进行抵销。
法院判决或仲裁裁决：在诉讼或仲裁过程中，如果法院或仲裁机构认定违约方应支付违约金或赔偿损失，且该金额可以从货款中扣除，那么这种扣除是合法的。但这种情况下的扣除是基于法院或仲裁机构的判决或裁决，而非单方面决定。
四、特别注意事项
违约金与货款的区别：违约金是合同双方约定的因违约而应支付的金钱，其金额和支付方式通常由合同约定。而货款是买方因购买货物而应支付给卖方的金钱。两者在性质、目的和支付方式上均存在差异，因此不能简单地将违约金等同于货款进行扣除。
合同条款的审查：在签订合同时，双方应仔细审查合同条款，特别是关于违约责任和货款支付的条款。确保合同条款明确、具体且合法有效，以避免因合同条款不明确或违法而导致纠纷。
法律程序的遵循：如果发生违约纠纷，双方应首先尝试通过协商解决。如果协商无果，可以寻求法律途径解决。在诉讼或仲裁过程中，应遵循法律程序，尊重法院或仲裁机构的判决或裁决。
综上所述，违约并不能直接扣除全部货款。货款的处理方式需依据合同约定、违约性质及法律规定来确定。如果双方在合同中有明确约定且该约定合法有效，或者符合法定抵销的条件且经过法院或仲裁机构的判决或裁决，那么货款可能会被扣除或抵销。但无论如何，都不能单方面决定扣除全部货款作为违约的处理方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。