针对“三年前已退挪用款”的处理，核心结论需结合具体情形判断，以下分情况说明：

1. 刑事责任层面：若挪用行为涉嫌犯罪，退还款项不必然免除刑事责任
   根据《刑法》第三百八十四条，挪用公款罪的成立需满足“数额较大、超过三个月未还”或“进行营利活动”“非法活动”等要件。若三年前挪用行为已构成犯罪，即使后续退还款项，仍可能面临刑事追诉。但退赃可作为量刑情节，根据《最高人民法院关于常见犯罪的量刑指导意见》，退赃可减少基准刑的30%以下。需注意：若挪用公款数额巨大且超过三个月未还，或进行非法活动，追诉时效为十年；若数额较大且未进行非法活动，追诉时效为五年。若当前已超过追诉时效，则不再追究刑事责任。

2. 民事责任层面：若挪用行为造成单位损失，单位仍有权主张赔偿
   即使款项已退还，若挪用期间产生利息、投资损失等间接损失，单位可依据《民法典》第一百七十九条要求赔偿。例如，挪用公款用于个人投资导致单位资金成本增加，单位可要求赔偿利息损失。但需注意：若单位已明确放弃赔偿请求权，或损失与挪用行为无直接因果关系，则单位主张可能不被支持。

3. 行政责任层面：若涉及职务违法，可能面临纪律处分
   根据《公职人员政务处分法》第四十条，挪用公款可能面临警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等处分。即使款项已退还，若行为违反单位规章制度或公职人员纪律要求，仍可能被追究行政责任。处分期限需结合具体情节，例如挪用数额较大且情节严重，可能面临开除处分。

4. 实务建议：主动配合调查并固定证据
   若当前面临刑事调查或单位追责，建议：

   • 配合司法机关或单位调查，如实说明资金用途、退还时间等关键事实；
     
   • 保留退还款项的转账记录、单位收据等证据，证明退还主动性；
     
   • 若涉及刑事案件，可委托律师介入，争取从轻情节（如自首、立功、认罪认罚等）。
     

如有进一步法律问题，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业分析。