非法占用基本农田的强拆，其执行主体主要依据具体情况及法律法规来确定，以下是详细分析：

1. 县级以上人民政府自然资源主管部门

   • 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》第七十七条，非法占用土地进行建设的，由县级以上人民政府自然资源主管部门（通常为自然资源局）责令退还土地，并限期拆除违法建筑。若当事人不服决定且不申请复议、不起诉又不拆除，行政机关可申请法院强制执行。
   • 适用情形：当非法占用基本农田进行建设时，县级以上人民政府自然资源主管部门是主要的执法和处罚主体，负责责令退还土地、限期拆除违法建筑，并在必要时申请法院强制执行。

2. 乡镇政府（在特定情况下）

   • 法律依据：虽然《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条主要针对乡、村庄规划区内的违建房屋，但若基本农田位于乡、村庄规划区内，且违建行为同时违反了城乡规划，乡镇政府在特定情况下也可能参与处理。不过，对于非法占用基本农田的强拆，乡镇政府通常不是直接执行主体，除非得到上级政府的明确授权或委托。
   • 适用情形：在基本农田位于乡、村庄规划区，且违建行为同时违反城乡规划的特殊情况下，乡镇政府可能根据上级政府的授权或委托参与处理，但一般不是直接执行强拆的主体。

3. 法院（作为强制执行机关）

   • 法律依据：当行政机关（如县级以上人民政府自然资源主管部门）作出拆除违法建筑的决定后，若当事人在法定期限内既不复议也不诉讼，同时又不自行拆除违建，行政机关可依法申请法院强制执行。
   • 适用情形：在非法占用基本农田的强拆案件中，若当事人不履行行政机关的拆除决定，行政机关将申请法院强制执行，由法院作为最终的强制执行机关。

执行流程与注意事项：

• 行政处罚决定的作出：县级以上人民政府自然资源主管部门或相关执法部门会首先作出行政处罚决定，明确要求退还土地、限期拆除违法建筑。
• 法律救济途径：当事人在收到处罚决定后，有权在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
• 强制执行的实施：若当事人在法定期限内既不复议也不诉讼，同时又不自行拆除违建，行政机关将依法申请法院强制执行。法院将根据具体情况，决定是否实施强制执行，并可能责成相关部门（如自然资源局、乡镇政府等）具体执行。

结论与建议：

非法占用基本农田的强拆执行主体并非单一，而是根据具体情况及法律法规的规定来确定。在大多数情况下，县级以上人民政府自然资源主管部门是主要的执法和处罚主体。若当事人不履行拆除决定，行政机关将申请法院强制执行。因此，在处理此类问题时，应仔细分析案件的具体情况，并依据相关法律法规进行妥善处理。若您面临非法占用基本农田的强拆问题，或对此有任何疑问，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。