合同被法院确认为无效合同后，当事人的损失赔偿及返还财产原则上受诉讼时效限制，但存在例外情形。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同无效的确认不受诉讼时效限制
合同无效是指合同因严重欠缺有效要件，自始就不具有法律效力。这种无效是合同本身固有的属性，由法律直接规定，不依赖于当事人的主张或时间经过而改变。因此，合同无效的确认本身不受诉讼时效的限制。无论经过多长时间，一旦合同被法院确认为无效，该合同自始无效，不会因时间的流逝而改变其无效的状态。
二、基于合同无效产生的损失赔偿及返还财产请求权受诉讼时效限制
虽然合同无效的确认不受诉讼时效限制，但基于合同无效而产生的损失赔偿及返还财产请求权则属于债权请求权，受到诉讼时效的约束。具体来说：
损失赔偿请求权：当合同被确认无效后，如果一方因合同无效而遭受了损失，其有权要求另一方进行赔偿。这种赔偿请求权属于债权请求权，应当受到诉讼时效的限制。通常，此类请求权的诉讼时效为三年，自当事人知道或者应当知道合同无效以及对方造成其损失之日起算。
返还财产请求权：在合同无效的情况下，一方因合同而取得的财产应当返还给另一方。这种返还财产请求权同样属于债权请求权，原则上受到诉讼时效的限制。然而，在某些特殊情况下，如返还的财产属于物权范畴（如房屋、土地等不动产或特定动产），且物权人能够证明其物权未因时间流逝而消灭或变更的，返还财产的请求可能不受诉讼时效的限制。这是因为物权具有支配性和排他性，只要物权存在，物权人即可随时要求返还。但这种情况需要具体案件具体分析，不能一概而论。
三、诉讼时效的中止与中断
在诉讼时效期间内，如果因某些法定事由（如不可抗力、无民事行为能力或限制民事行为能力等）导致当事人不能行使请求权的，诉讼时效可能会中止。待障碍消除后，诉讼时效继续计算。另外，如果权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等情形发生，则诉讼时效可能中断并重新起算。
四、实际操作建议
及时行使权利：当事人在合同被确认无效后，应当及时行使损失赔偿及返还财产的请求权，避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
保留相关证据：为了证明自己的请求权未超过诉讼时效，当事人应当保留好相关证据，如合同、付款凭证、损失证明等。
咨询专业律师：在处理合同无效纠纷时，如果涉及复杂的法律问题或证据收集困难等情况，建议及时向我咨询，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，合同被法院确认为无效合同后，当事人的损失赔偿及返还财产请求权原则上受诉讼时效限制，但存在例外情形。当事人在处理此类纠纷时，应当及时行使权利并保留好相关证据，以便在必要时进行维权。