工厂跨市搬迁时，员工是否有赔偿取决于具体情况，主要分析如下：
一、有赔偿的情况
搬迁导致劳动合同无法继续履行
- 当工厂跨市搬迁，且新地点距离原工作地点过远，导致员工通勤时间大幅增加、成本显著提高，甚至需要更换居住地点，从而难以继续按照原劳动合同提供劳动时，视为搬迁对劳动合同的履行产生了重大影响。
- 在此情况下，若工厂未能与员工就变更劳动合同内容（如工作地点、通勤补贴等）达成协议，员工有权拒绝随迁并提出解除劳动关系，工厂应依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，向员工支付经济补偿金。
违反劳动合同中明确的工作地点约定
- 如果劳动合同中明确约定了工作地点，且工厂在合同期内无故搬迁至其他地点，导致员工通勤时间过长或其他损失，属于违反劳动合同约定。员工有权要求工厂支付经济补偿金。
经济补偿的标准
- 经济补偿按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
- 若员工月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿标准按职工月平均工资三倍的数额支付，最高不超过十二年。这里的“月工资”指的是员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
二、没有赔偿的情况
搬迁对劳动合同履行影响不大
- 若工厂跨市搬迁的距离较近，或者虽然距离较远但工厂提供了交通补贴、班车接送等便利条件，从而降低了搬迁的不利影响，使劳动合同能够继续履行，此时搬迁对劳动合同的履行影响不大。
- 在这种情况下，员工继续履行劳动合同不能要求经济补偿金。
劳动合同中未明确具体工作地点或约定过于宽泛
- 如果劳动合同中没有约定具体的工作地点，或仅约定了某市等宽泛的范围，那么用人单位在该市内或跨市但影响不大的情况下调整工作地点是合理的。员工应当服从，并因此辞职要求经济补偿的请求不会得到支持。
三、其他可能的赔偿与注意事项
- 未提前通知的代通知金：若工厂未提前三十日以书面形式通知员工解除劳动合同，还需额外支付一个月工资作为代通知金。
- 直接经济损失赔偿：如因搬迁导致员工产生其他直接经济损失（如重新租赁住房费用、搬家费用等），员工可收集证据要求工厂合理赔偿。
- 支付义务与时间：工厂应确保经济补偿金金额准确无误，并在规定时间内支付给员工。
四、赔偿流程与法律途径
- 协商：首先，员工可与工厂管理层就赔偿事宜进行协商，争取达成双方都能接受的赔偿方案。
- 申请劳动仲裁：若协商不成，员工可向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提交相关证据材料。
- 提起诉讼：对仲裁结果不满意时，员工可在规定时间内向人民法院提起诉讼，由法院根据证据和法律规定进行审理并判决。
总结来说，工厂跨市搬迁时，员工是否有赔偿需综合考虑搬迁对劳动合同履行的影响、劳动合同中的相关约定以及工厂是否采取了合理弥补措施等因素。在实际操作中，建议工厂在搬迁前与员工充分沟通，协商解决方案，以避免不必要的法律纠纷。同时，员工也应了解自己的权益和义务，在合法权益受到侵害时及时寻求法律帮助，可以直接向我咨询相关问题。