协议到期后对方仅偿还部分款项（如几千元），若需强制执行剩余债务，需按以下步骤操作：

1. 确认债权合法性及剩余金额

   • 需提供原始协议（如借款合同、还款协议等）作为债权依据，证明双方存在明确的债权债务关系。
     
   • 计算对方已偿还金额与总债务的差额，明确剩余未履行部分（如本金、利息、违约金等），确保诉求金额准确无误。
     
   • 注意：若协议中约定了分期还款、利息计算方式等条款，需严格按约定核算剩余债务，避免因计算错误影响执行。

2. 通过法律程序确认债权（若未经过诉讼/仲裁）

   • 若未起诉：需先向法院提起民事诉讼（或申请仲裁，依协议约定），获得生效判决书/调解书/裁决书后，方可申请强制执行。
     
   • 若已起诉但未申请执行：需在判决书/调解书生效后2年内（执行时效）向法院申请强制执行，逾期可能丧失执行权利。
     
   • 关键点：强制执行必须以“生效法律文书”为前提，口头协议或未经过法律确认的债权无法直接申请执行。

3. 向法院申请强制执行

   • 准备材料：强制执行申请书（需写明双方信息、执行请求、事实理由）、生效法律文书原件及复印件、申请人身份证明（如身份证、营业执照）、被执行人财产线索（如银行账户、房产、车辆等）。
     
   • 提交法院：向第一审人民法院（或与仲裁裁决对应的法院）提交申请，法院受理后会向被执行人发出执行通知，责令其限期履行。
     
   • 提示：若不知被执行人财产线索，可申请法院调查，但提供线索能提高执行效率。

4. 法院采取的执行措施

   • 查询、冻结、划拨存款：法院可查询被执行人银行账户，直接冻结或划拨存款至申请人账户。
     
   • 查封、扣押、拍卖财产：对被执行人名下房产、车辆、股权等财产进行查封，通过拍卖变现偿还债务。
     
   • 限制高消费及纳入失信名单：对被执行人限制乘坐飞机、高铁、入住高档酒店等，并纳入失信被执行人名单，影响其信用及日常活动。
     
   • 司法拘留或追究拒执罪：若被执行人隐匿财产、拒不履行，法院可对其司法拘留（最长15日）；情节严重者，可能构成“拒不执行判决、裁定罪”，追究刑事责任。

5. 特殊情况处理

   • 被执行人无财产可供执行：法院会终结本次执行程序，但申请人发现财产后可随时申请恢复执行。
     
   • 被执行人下落不明：法院可通过公告送达执行通知，并依职权调查财产，若确无财产则可能暂缓执行。
     
   • 协议中有担保条款：若债务有保证人或抵押物，可同时起诉担保人或申请拍卖抵押物优先受偿。

总结：强制执行需以生效法律文书为前提，通过法院依法对被执行人财产采取措施实现债权。若您已持有判决书/调解书，可直接准备材料申请执行；若尚未通过法律程序确认债权，需先起诉或仲裁。执行过程中若遇困难，可进一步向我咨询具体操作细节。