您好，针对您提出的“办理自主实习但第三方协议没有弄，是否会影响拿到毕业证”的问题，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，第三方协议（即三方协议）的签订并不是毕业证的发放条件。根据教育部等八部门印发的《职业学校学生实习管理规定》以及相关教育法规，毕业证的发放主要依据的是学生是否完成了学校规定的学习任务，包括课程学习、实习实训、毕业设计（论文）等，并且达到了学校规定的毕业标准。
然而，在实际操作中，有些学校可能会将签订三方协议作为实习管理的一部分，或者将其与学生的就业情况挂钩，进而间接影响毕业证的发放。但这种做法并不符合教育部的相关规定，也不应该成为影响学生毕业的硬性条件。
针对您的情况，如果您已经按照学校的要求完成了自主实习，并且实习期间的表现也符合学校的要求，那么即使没有签订三方协议，也不应该影响您拿到毕业证。当然，为了确保自己的权益，您可以采取以下措施：
与学校沟通：主动与学校的相关部门（如教务处、学生处或实习管理部门）沟通，了解学校对于实习和毕业证发放的具体规定，以及三方协议在其中的作用。
保留实习证据：保留好您自主实习的相关证据，如实习单位出具的实习证明、实习期间的考勤记录、实习报告等，以证明您已经完成了实习任务。
了解维权途径：如果学校以未签订三方协议为由拒绝发放毕业证，您可以向学校的相关部门提出申诉，或者向当地的教育行政部门投诉，维护自己的合法权益。
综上所述，办理自主实习但第三方协议没有弄，并不应该直接影响您拿到毕业证。但为了确保自己的权益，建议您与学校保持沟通，并保留好相关证据。如果遇到问题，及时寻求维权途径。希望这些解答能够对您有所帮助。