若您想以子公司工作但社保在母公司缴纳的情况申请劳动仲裁，核心结论是需明确仲裁对象与争议焦点，根据不同情况选择合适的仲裁策略，具体分析如下：
明确仲裁对象与争议焦点
首先需明确您与哪家公司存在实际劳动关系。根据《劳动争议调解仲裁法》第二十二条，劳动争议的仲裁对象应为与您建立劳动关系的用人单位。若您实际在子公司工作、接受子公司管理并由子公司发放工资，但社保由母公司代缴，此时劳动关系主体应为子公司，仲裁对象应为子公司。若母公司直接与您签订劳动合同、安排工作并支付工资，则劳动关系主体为母公司，仲裁对象应为母公司。
争议焦点通常包括：社保缴纳主体与劳动关系主体不一致是否违法（如未以实际用人单位名义缴纳社保）、社保缴费基数是否符合实际工资水平、是否因社保问题导致您权益受损（如无法享受医保报销、生育津贴等）。
分情况选择仲裁策略
- 情况一：劳动关系在子公司，社保由母公司代缴但未以子公司名义缴纳
若子公司未以自身名义为您缴纳社保，而是通过母公司账户代缴，可能违反《社会保险法》第五十七条（用人单位应自成立之日起30日内办理社保登记）及第五十八条（用人单位应自用工之日起30日内为员工办理社保登记）。此时您可向子公司所在地劳动仲裁委申请仲裁，要求子公司以自身名义补缴社保或赔偿因社保缴纳不规范导致的损失（如无法享受社保待遇的差额）。
- 情况二：劳动关系在母公司，但实际在子公司工作
若您与母公司签订劳动合同，但被派至子公司工作，此时劳动关系主体仍为母公司。若母公司未为您缴纳社保或缴费基数低于实际工资，您可直接向母公司所在地劳动仲裁委申请仲裁，要求母公司补缴社保或补足缴费基数差额。
- 情况三：子公司与母公司存在关联关系，但劳动关系主体不明确
若子公司与母公司存在混同用工（如工资由母公司发放、工作由子公司安排），且未明确劳动合同签订主体，此时可能构成“双重劳动关系”或“关联企业连带责任”。根据《劳动合同法》第九十四条及《公司法》第二十条，您可同时将子公司与母公司列为被申请人，要求二者承担连带责任，仲裁管辖地可选择子公司或母公司所在地（根据实际工作地或劳动合同履行地确定）。
仲裁申请材料与流程
无论哪种情况，申请仲裁均需准备以下材料：
- 仲裁申请书（明确被申请人、仲裁请求、事实与理由）；
- 身份证明（身份证复印件）；
- 劳动关系证明（劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等）；
- 社保缴纳证明（社保缴费记录，可通过社保局官网或APP下载）；
- 争议相关证据（如母公司代缴社保的协议、子公司安排工作的通知等）。
流程为：向有管辖权的劳动仲裁委提交材料→仲裁委受理（5日内决定是否受理）→开庭审理→仲裁裁决（通常45日内作出，复杂案件可延长15日）。
温馨提示：社保争议属于劳动争议范畴，但部分地区可能要求先向社保行政部门投诉（如要求补缴社保），对行政处理结果不服后再申请仲裁。建议您先咨询当地社保局或劳动仲裁委，确认具体流程。若您需进一步分析劳动关系主体或准备仲裁材料，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细指导。