在打官司时，原始合同被修改后，是按原合同算还是按现在的合同算，这主要取决于修改是否合法有效以及双方当事人的意思表示。以下从不同角度进行分析：

1. 修改合法有效且双方认可的情况：

   • 如果合同的修改是经过双方当事人协商一致，并且没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么这种修改是合法有效的。在这种情况下，应当按照修改后的合同（即现在的合同）来履行和判断双方的权利义务。因为合同是双方当事人意思表示的体现，修改后的合同反映了双方最新的意思表示。

2. 修改不合法或一方不认可的情况：

   • 如果合同的修改存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，或者修改的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么这种修改是无效的。在这种情况下，应当按照原始合同来履行和判断双方的权利义务。因为无效的修改不具有法律效力，不能改变原始合同的效力。
   • 另外，如果一方当事人未经另一方当事人同意，擅自修改合同内容，这种修改也是无效的。同样，应当按照原始合同来履行和判断双方的权利义务。

3. 修改部分有效部分无效的情况：

   • 有时候，合同的修改可能部分有效部分无效。比如，修改的内容中有些条款是合法有效的，有些条款是无效的。在这种情况下，应当按照有效部分来履行和判断双方的权利义务，无效部分则按照原始合同的相关规定或者法律规定来处理。

法律建议：

• 在签订合同时，建议双方当事人尽量明确合同的内容，避免模糊不清或者存在歧义，以减少后续修改的可能性。
• 如果确实需要修改合同，建议双方当事人协商一致，并签订书面的修改协议，以确保修改的合法性和有效性。
• 在打官司时，如果涉及到合同修改的问题，建议当事人提供充分的证据来证明修改的合法性和有效性，或者证明修改的无效性，以便法院能够准确判断双方的权利义务。

可能后果：

• 如果按照修改后的合同履行和判断双方的权利义务，但修改被认定为无效，那么一方当事人可能会因为履行了无效的合同而遭受损失，并可能需要承担相应的法律责任。
• 如果按照原始合同履行和判断双方的权利义务，但修改被认定为有效，那么另一方当事人可能会因为未按照修改后的合同履行而构成违约，并可能需要承担相应的违约责任。

因此，在处理合同修改的问题时，建议当事人谨慎对待，并咨询专业律师的意见，以确保自己的合法权益得到保护。如果你有任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的解答。