针对您提出的“台球助教签了协议没做满三个月，扣3000是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，我们要明确的是，原则上用人单位不得随意对员工工资进行扣罚。这是基于劳动法的基本原则，即保护劳动者的合法权益，确保劳动者的劳动报酬不受非法侵占。
接下来，我们考虑特殊情况。在以下两种情形下，用人单位可能可以对员工进行经济处罚：
员工给用人单位造成了实际经济损失：如果员工在履行职责过程中，由于故意或重大过失给用人单位造成了经济损失，用人单位有权要求员工进行赔偿。但这种赔偿应当是合理的，并且需要与员工造成的实际损失相匹配。
按照规章制度的规定：如果用人单位在规章制度中明确规定了某些情况下可以对员工进行经济处罚，并且这些规章制度是经过合法程序制定、公示并告知员工的，那么在这些情况下，用人单位可能可以对员工进行一定的经济处罚。但即便如此，处罚的金额也不得超过员工当月工资的20%，这是为了保护劳动者的基本生活需求。
现在，我们回到您提出的具体问题。如果台球助教签了协议但没做满三个月，用人单位就扣3000元，这很可能是不合法的。除非能够证明该助教给用人单位造成了实际经济损失，并且这个损失金额确实达到了3000元，或者用人单位的规章制度中有明确规定，并且这个规定是合法有效的，同时处罚金额也没有超过当月工资的20%。但在没有这些特殊情况的前提下，用人单位随意扣罚员工工资是违法的。
因此，我建议您先与用人单位进行沟通，了解扣罚的具体原因和依据。如果认为用人单位的扣罚行为不合理或违法，您可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。