讨要单位扣留的合同确实存在时效问题，但具体时效的适用需根据合同类型及请求权基础来确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同类型与请求权基础的影响
劳动合同：
- 若单位扣留的是劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。用人单位未将劳动合同文本交付劳动者的，由劳动行政部门责令改正；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。
- 在此情况下，劳动者讨要劳动合同的请求权基础主要是基于劳动合同法的规定，而非一般的债权请求权。因此，不直接适用诉讼时效的规定。但若因单位扣留合同导致劳动者遭受实际损失（如无法证明劳动关系、无法享受社保待遇等），劳动者可就损失赔偿部分主张权利，此时可能涉及诉讼时效的问题，一般诉讼时效期间为三年，自劳动者知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
其他类型合同：
- 若单位扣留的是其他类型的合同（如买卖合同、服务合同等），则讨要合同的请求权基础可能基于物权请求权或债权请求权。
- 物权请求权：若合同本身具有物权属性（如合同标的物为特定物，且合同与该物紧密相关），则讨要合同可能构成对物权的保护请求，此时不适用诉讼时效的规定。
- 债权请求权：若讨要合同主要是基于合同内容（如要求履行合同义务、确认合同效力等），则可能构成债权请求权。在此情况下，诉讼时效的适用需根据具体请求内容来确定。一般债权请求权的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但需注意，若合同中约定了履行期限，则诉讼时效可能自履行期限届满之日起计算。
二、时效中断与中止的情形
- 时效中断：在诉讼时效期间内，若权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等，则诉讼时效中断，从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算。
- 时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力或其他障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
三、法律建议
- 及时主张权利：无论合同类型如何，若您认为单位扣留合同的行为侵犯了您的合法权益，建议及时与单位沟通协商，要求返还合同或就合同内容达成一致。若协商无果，可考虑通过法律途径解决。
- 注意时效问题：在主张权利时，需注意诉讼时效的问题。若可能涉及诉讼时效的适用，建议尽快咨询专业律师，以确定具体的诉讼时效期间及中断、中止的情形。
- 保留证据：在讨要合同的过程中，建议保留好相关证据（如沟通记录、邮件、短信等），以证明您曾向单位主张过权利或单位存在扣留合同的行为。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。