拥有依法登记的土地使用权证，并不意味着一定不会按争议案件处理。这主要取决于是否存在土地权属争议以及争议的具体情况。以下从不同角度进行分析：

一、土地使用权证的法律效力

依法登记的土地使用权证是土地权利人享有土地使用权的法律凭证。它表明了土地权利人已经按照法定程序取得了土地使用权，并受到了法律的保护。在一般情况下，拥有土地使用权证的土地权利人，其土地使用权是受到法律确认和保护的，不易受到他人的非法侵害。

二、土地权属争议的存在

然而，即使拥有土地使用权证，也不能完全排除土地权属争议的可能性。土地权属争议可能由于多种原因产生，例如：

1. 历史遗留问题：如土地改革、四固定等历史时期遗留下来的土地权属问题，可能因历史资料缺失或记录不清而引发争议。
2. 相邻关系纠纷：如土地边界不清、相邻土地使用人之间的使用权争议等。
3. 非法侵占或转让：如他人非法侵占土地或非法转让土地使用权，导致原土地权利人与其产生争议。

三、争议案件的处理方式

当存在土地权属争议时，即使土地权利人拥有土地使用权证，也可能需要按照争议案件进行处理。处理方式通常包括以下几种：

1. 协商调解：双方当事人可以自行协商或请求相关部门进行调解，以达成和解协议。
2. 行政处理：当事人可以向当地人民政府或土地管理部门申请行政处理，由相关部门进行调查、核实并作出处理决定。
3. 司法诉讼：如果协商调解或行政处理无法解决争议，当事人可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序解决争议。

四、土地使用权证在争议处理中的作用

在土地权属争议处理过程中，土地使用权证是重要的证据之一。它证明了土地权利人已经依法取得了土地使用权，并有助于确定土地权属的归属。然而，土地使用权证并不是唯一的证据，其他相关证据（如历史资料、相邻关系证明等）也可能对争议的处理产生重要影响。

五、建议与注意事项

1. 妥善保管土地使用权证：土地权利人应妥善保管自己的土地使用权证，避免遗失或损坏。
2. 及时处理争议：一旦发现土地权属争议，应及时采取措施进行处理，避免争议扩大或升级。
3. 寻求专业法律帮助：在处理土地权属争议时，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的合法权益得到充分保护。

如果您在土地权属方面遇到任何问题或争议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。