法人公司注册的管理部门主要涉及到市场监督管理部门。具体来说，根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》的相关规定，我们可以明确以下几点：

首先，国务院市场监督管理部门是主管全国市场主体登记管理工作的最高部门。这意味着，从国家层面来看，市场监督管理部门负责制定和执行市场主体登记管理的相关政策和规范。

其次，县级以上地方人民政府市场监督管理部门则主管本辖区内的市场主体登记管理工作。这包括了对法人公司注册申请的受理、审核、批准以及后续的监督管理等职责。因此，当您想要在某个具体地区注册法人公司时，需要前往该地区的市场监督管理部门进行办理。

此外，市场监督管理部门在登记管理过程中，会遵循依法合规、规范统一、公开透明、便捷高效的原则，以优化营商环境，保护市场主体的合法权益。他们会提供一系列的服务，如优化登记办理流程、提高登记效率、推行当场办结、一次办结、限时办结等制度，以及实现集中办理、就近办理、网上办理、异地可办等，以提升市场主体登记的便利化程度。

综上所述，如果您想要注册法人公司，应该前往县级以上地方人民政府市场监督管理部门进行办理。在办理过程中，您需要按照相关规定提交必要的文件和资料，如《公司登记(备案)申请书》、公司章程、股东或发起人的主体资格文件或自然人身份证明等。市场监督管理部门会对您的申请进行审核，并在符合规定的情况下批准您的注册申请，颁发营业执照。