身份证被别人拿去注册公司，主要由工商行政管理部门（如工商局）负责处理此事。

一. 工商行政管理部门的职责

1. 市场主体登记管理：根据相关法律法规，工商行政管理部门负责市场主体的登记管理工作，包括公司的注册登记。因此，当身份证被别人拿去注册公司时，首先涉及的就是工商行政管理部门。

2. 审查义务：工商行政管理部门在办理公司注册登记时，需要对申请材料进行审查。虽然主要是形式审查，但也需要确保材料齐全、符合法定形式，并尽可能识别出伪造或虚假的材料。

二. 相关法律依据

• 《中华人民共和国市场主体登记管理条例》：该条例明确规定了工商行政管理部门在市场主体登记管理中的职责和权力，以及申请人应提交的材料和要求。

三. 应对措施

1. 向工商行政管理部门反映：发现身份证被冒用注册公司后，应立即向当地工商行政管理部门反映情况，并提供相关证据。

2. 申请撤销登记：在提供证据后，可向工商行政管理部门申请撤销被冒用身份证注册的公司的工商登记。

综上所述，身份证被别人拿去注册公司，主要由工商行政管理部门负责处理。若发现此类情况，应及时向工商行政管理部门反映，并采取相应措施维护自身权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。