结论概述：在小程序立案后，若借款人还款而原告不撤诉，案件将继续进行，借款人可能面临法院的判决及相应的法律后果，同时原告也可能因不撤诉而承担一定的诉讼成本。以下是对此问题的详细分析：

1. 案件继续进行的法律程序：

   • 一旦案件在小程序立案，即意味着诉讼程序已经启动。此时，无论借款人是否还款，案件都将按照法律规定的程序继续进行，直至法院作出最终判决。
   • 借款人还款并不构成撤诉的法定理由。撤诉是原告的权利，但原告是否选择撤诉，取决于其自身的意愿和诉讼策略。

2. 借款人可能面临的法律后果：

   • 如果借款人已经还款，但原告不撤诉，借款人可以在法庭上提供还款证据，以证明其已经履行了还款义务。
   • 法院在审理案件时，会综合考虑双方提供的证据和事实，如果确认借款人已经还款，法院可能会判决驳回原告的诉讼请求，或者根据具体情况作出其他公正的判决。
   • 如果借款人未完全还款或存在其他违约行为，法院可能会判决借款人继续履行还款义务，并可能承担逾期利息、违约金等额外费用。

3. 原告不撤诉可能承担的成本：

   • 原告选择不撤诉，将继续承担诉讼费用，包括但不限于案件受理费、律师费等。
   • 如果法院最终判决驳回原告的诉讼请求，原告不仅无法获得预期的债权，还可能因诉讼而遭受经济损失，如诉讼费用的支出、时间成本的浪费等。
   • 在某些情况下，如果原告滥用诉讼权利，恶意诉讼，还可能面临法院的处罚，如罚款、拘留等。

4. 建议与策略：

   • 对于借款人而言，如果已经还款，建议及时与原告沟通，了解其不撤诉的原因，并尝试通过协商达成和解，以避免不必要的法律纠纷和诉讼成本。
   • 如果协商无果，借款人应积极准备应诉材料，提供还款证据，以维护自己的合法权益。
   • 对于原告而言，如果借款人已经还款，应理性评估撤诉的利弊，考虑撤诉以减少诉讼成本和风险。如果认为借款人存在其他违约行为或需要进一步追究其法律责任，可以在撤诉后另行起诉或采取其他法律措施。

总结与启示：在小程序立案后，借款人还款而原告不撤诉的情况下，案件将继续进行，双方都应积极应对，准备应诉材料或提供证据，以维护自己的合法权益。同时，双方也应理性评估撤诉的利弊，考虑通过协商达成和解，以减少诉讼成本和风险。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。