结论：是否配合开发票需分情况讨论，若该笔款项属于应税收入且您有开具发票的法定义务，则应配合；若不符合应税条件或存在其他法律风险，则不建议配合。以下为具体分析：

1. 款项性质决定是否应税
   根据《增值税暂行条例》及实施细则，销售货物、提供劳务、服务、无形资产或不动产等经营活动的收入属于应税范围。若对方支付的5万元属于您提供上述应税行为的对价（如您为对方提供了服务、销售了商品等），则该款项属于应税收入，您有义务向对方开具发票。此时配合开发票是合法合规的，且可能涉及您的纳税申报义务。

2. 非应税收入无需开发票
   若该5万元属于非经营性收入（如借款、赠与、赔偿款等），则不属于增值税应税范围，您无需开具发票。此时若对方强行要求开发票，可能涉及虚开发票的违法风险（根据《发票管理办法》，虚开发票包括为他人开具与实际经营业务情况不符的发票）。您有权拒绝此类要求，并可向税务机关举报对方违法行为。

3. 时间因素不影响发票义务
   发票开具义务与款项支付时间无关，即使款项已支付一年，只要属于应税收入，您仍需补开发票（根据《发票管理办法》，销售商品、提供服务后，收款方应向付款方开具发票）。但需注意，若超过纳税申报期限，可能需补缴税款及滞纳金，建议尽快处理。

4. 风险提示

   • 若您未按规定开具发票，可能面临税务机关处罚（如罚款、没收违法所得等）；
     
   • 若对方利用您开具的发票进行虚开、骗税等违法行为，您可能因“善意取得”或“共同违法”承担连带责任；
     
   • 建议保留款项性质的相关证据（如合同、聊天记录、服务成果等），以证明收入性质，避免税务争议。

建议行动：

1. 核实5万元款项的具体性质（是否为应税收入）；
   
2. 若是应税收入，尽快补开发票并完成纳税申报；
   
3. 若非应税收入，明确拒绝对方要求，并留存拒绝证据；
   
4. 如有疑问，可进一步向我提供款项背景，我将协助分析法律风险。