关于您提出的“代开增值税专用发票的合同有争议是否负法律责任”的问题，这确实是一个涉及法律与税务的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，开具增值税专用发票本身并不绝对要求必须有合同。根据《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则，以及《国家税务总局关于纳税人对外开具增值税专用发票有关问题的公告》，发票的开具应基于真实的交易事项，而并未明确规定必须提供合同。然而，合同在证明交易真实性、明确双方权利义务以及降低税务风险方面，却扮演着至关重要的角色。
合同在开具增值税专用发票中的作用
证明交易真实性：合同是交易双方意思表示一致的书面证明，它详细记录了交易的内容、数量、金额、付款方式等关键信息。在税务机关审查时，合同是证明交易真实性的重要依据。如果合同存在争议或不明确，可能会引发税务机关对交易真实性的质疑，进而可能带来税务风险。
明确双方权利义务：合同中约定的条款有助于确保发票的开具准确无误，并与交易内容保持一致。如果合同条款存在争议或模糊不清，可能会导致发票开具错误或与实际交易不符，从而引发纠纷。
降低税务风险：签订合同可以规范交易行为，防止欺诈和纠纷。在税务筹划和风险管理方面，合同也是重要的依据。如果合同存在争议，可能会被视为交易不规范或存在欺诈行为，从而增加税务风险。
合同争议与法律责任
当合同存在争议时，是否需要负法律责任取决于争议的具体内容和性质。如果争议涉及合同的有效性、履行情况或违约责任等，那么根据合同法的相关规定，争议双方可能需要承担相应的法律责任。在开具增值税专用发票的情境下，如果合同争议导致交易真实性受到质疑或发票开具错误，那么相关方可能会面临税务机关的处罚或法律诉讼。
实际操作建议
咨询专业律师或税务机关：在签订合同或开具增值税专用发票前，建议咨询专业律师或当地税务机关，以确保合同条款的合法性和合规性，以及发票开具的准确性。
完善合同条款：在签订合同时，应尽可能完善合同条款，明确交易内容、金额、付款方式等关键信息，以降低合同争议的风险。
保留交易证据：无论是否签订合同，都应妥善保存交易过程中的相关证据和记录，如交货单、付款凭证等，以备税务机关检查或法律诉讼时使用。
综上所述，虽然开具增值税专用发票并不绝对要求必须有合同，但合同在证明交易真实性、明确双方权利义务以及降低税务风险方面具有重要作用。如果合同存在争议，可能会引发税务风险或法律责任。因此，在实际操作中，建议企业根据交易性质、金额大小及当地税务机关的具体规定来决定是否需要签订合同，并尽可能完善合同条款以降低风险。