结论：针对公司已给包工头结算清但包工头欠机械费的问题，您可以从以下几个角度来考虑和解决：一是尝试与包工头协商解决；二是如果协商无果，可以考虑通过法律途径来追讨欠款；三是如果机械费涉及第三方（如机械出租方），您还需要考虑与第三方的关系和责任划分。

详细分析：

1. 与包工头协商解决：

   • 首先，您可以尝试与包工头进行友好协商，了解他欠机械费的具体原因和困难。
   • 如果包工头确实存在经济困难，您可以考虑与他达成还款协议，比如分期还款或者延期还款，并明确还款的时间和金额。
   • 在协商过程中，建议您保留好相关的沟通记录和证据，以备后续需要。

2. 通过法律途径追讨欠款：

   • 如果协商无果，或者包工头拒绝还款，您可以考虑通过法律途径来追讨欠款。
   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，您有权要求包工头履行还款义务，并可以依法向人民法院提起诉讼。
   • 在提起诉讼前，建议您收集好相关的证据，如结算单、欠条、沟通记录等，以证明包工头确实欠您机械费。
   • 诉讼过程中，您需要按照法院的要求提交证据、参加庭审等，并积极配合法院的工作。
   • 如果法院最终判决包工头还款，但他仍然拒绝履行，您可以申请法院强制执行。

3. 考虑与第三方的关系和责任划分：

   • 如果机械费是您代包工头支付给第三方的（如机械出租方），那么您还需要考虑与第三方的关系和责任划分。
   • 在这种情况下，您可能需要与第三方协商，说明情况并寻求解决方案。如果第三方同意由您直接支付机械费，并放弃对包工头的追索权，那么您可以与第三方签订相关协议，并保留好协议作为证据。
   • 如果第三方坚持要求包工头支付机械费，并且您已经与包工头结算清，那么您可能需要向第三方说明情况，并告知他们包工头欠费的事实。在这种情况下，第三方可能会选择通过法律途径来追讨欠款，而您则需要配合提供相关证据和协助。

建议：

• 在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，避免与包工头发生不必要的冲突和纠纷。
• 如果您对法律程序不熟悉或者担心自己无法处理好此类问题，可以考虑咨询专业律师的意见和帮助。作为专业律师，我可以为您提供详细的法律咨询和代理服务，帮助您解决劳动工伤（工资福利）领域的问题。
• 在处理过程中，务必保留好所有相关的证据和沟通记录，以备后续需要。这些证据和记录将对您追讨欠款或者维护自己的合法权益起到至关重要的作用。