核心结论：不相邻的两块地能否一起办理设施农用地，需分情况讨论，主要取决于当地政策规定、土地利用总体规划以及实际用途的合理性。以下从不同角度展开分析：

1. 政策与规划层面
   根据《自然资源部、农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》等文件，设施农用地的审批需符合土地利用总体规划，且通常要求地块集中连片或功能关联。若两块地虽不相邻，但属于同一农业项目（如养殖场与饲料加工区），且符合规划要求，部分地区可能允许合并办理；但若规划明确要求地块连片，或两块地用途无直接关联（如一块种菜、一块建民宿），则可能被拒绝。

2. 实际用途合理性
   设施农用地的核心是服务于农业生产，若两块地因地形、水源等客观条件需分开布局（如灌溉水源地与种植区分离），且能证明其功能互补性，审批部门可能酌情允许；但若仅为扩大规模或规避限制而人为分割地块，则可能被认定为不符合“农业附属设施”的定位，导致审批失败。

3. 地方执行差异
   不同地区对设施农用地的管理尺度存在差异。例如，部分省份明确要求“单块设施农用地面积原则上不超过XX亩”，但未禁止多块合并；而另一些地区可能直接规定“必须为同一地块”。建议提前咨询当地自然资源部门或查阅最新政策文件，以地方答复为准。

建议行动：

• 第一步：向当地乡镇政府或自然资源所确认设施农用地的最新政策，重点询问“非连片地块能否合并审批”及“需满足哪些条件”；
  
• 第二步：准备材料证明两块地的功能关联性（如项目规划图、用途说明等）；
  
• 第三步：若政策允许但审批受阻，可申请行政复议或提起行政诉讼，主张行政行为合法性审查。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或政策解读。