结论：身份证和结婚证被男方扣留的情况下，您依然可以起诉离婚。以下是具体分析和建议：
一、法律层面：证件扣留不影响起诉离婚的权利
根据《民法典》及相关司法解释，起诉离婚是公民的法定权利，不因证件被扣留而丧失。法院受理离婚案件的核心条件是：
- 原告与本案有直接利害关系（即夫妻关系）；
- 有明确的被告（配偶身份信息）；
- 有具体的诉讼请求和事实理由；
- 属于法院管辖范围。
证件被扣留的解决方式：
- 身份证：可到户籍地派出所补办临时身份证或开具身份证明，效力与原件相同。
- 结婚证：若无法补办，可到婚姻登记机关调取婚姻登记档案（需携带身份证或身份证明），档案中的结婚登记信息可作为证明夫妻关系的证据。
二、实务操作：起诉离婚的具体流程
准备材料：
- 起诉状（需写明双方身份信息、诉讼请求、事实与理由）；
- 身份证明（临时身份证或派出所开具的证明）；
- 婚姻关系证明（婚姻登记档案或结婚证复印件，若均无，可申请法院调取）；
- 其他证据（如分居证明、感情破裂证据等，非必需但建议提供）。
提交法院：
- 到被告户籍地或经常居住地法院立案庭提交材料；
- 若被告下落不明或拒不接收材料，可公告送达（需额外时间）。
法院审理：
- 法院会先调解，调解不成则开庭审理；
- 若感情确已破裂（如家暴、分居满2年等），法院会判决离婚。
三、特殊情况处理
若男方拒绝配合：
- 法院可通过公告送达、缺席判决等方式推进程序，无需男方同意；
- 若男方扣留证件涉嫌违法（如限制人身自由），可报警处理。
若担心男方转移财产：
- 可在起诉时申请财产保全，冻结共同财产（需提供财产线索）；
- 若男方隐藏、转移财产，法院可少分或不分其财产。
四、建议与风险提示
- 优先协商：若双方能就离婚、财产、子女抚养达成一致，可到民政局协议离婚（无需起诉），但需男方配合返还证件。
- 及时起诉：若协商无果，建议尽快起诉，避免男方进一步转移财产或制造障碍。
- 证据收集：提前收集感情破裂、财产状况、子女抚养意愿等证据，提高诉讼效率。
总结：证件被扣留不会阻碍您起诉离婚的权利，通过补办身份证明、调取婚姻档案等方式即可完成立案。若需进一步帮助，可直接向我咨询具体操作细节。