您好，理解您现在的担忧和困惑。关于您提到的“结婚证在男方手里，女方要起诉离婚能否起诉”的问题，我可以明确地告诉您，即使结婚证在对方手中，女方仍然可以依法起诉离婚，维护自己的合法权益。

在我国，离婚主要有协议离婚和诉讼离婚两种方式。当结婚证被对方持有时，这并不构成起诉离婚的实质性障碍。您可以通过以下几种方式来启动离婚诉讼程序：

1. 申请补办结婚证：

   • 您可以携带本人身份证、户口本等相关证件，前往原办理婚姻登记的机关或一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请补办结婚证。
   • 婚姻登记机关会查证您的婚姻登记档案，确认属实后，会为您补发结婚证。
   • 补办完成后，您就可以凭借补办的结婚证、起诉状、身份证以及相关证据材料，向有管辖权的法院提起离婚诉讼。

2. 开具婚姻关系证明：

   • 如果补办结婚证不太方便，您还可以选择持本人身份证、户口本等材料，前往婚姻登记机关申请开具婚姻关系证明。
   • 这个婚姻关系证明与结婚证具有同等法律效力，能够作为证明双方婚姻关系的有效凭证。
   • 凭借婚姻关系证明、起诉状、身份证及其他相关证据材料，您同样可以向法院提起离婚诉讼。

3. 提供其他证明材料：

   • 在某些特殊情况下，如果居委会、村委会出具的证明材料，或者双方生育子女的出生证明等材料，结合双方共同生活的事实证据，也可以辅助证明双方存在婚姻关系。
   • 这些材料同样可以作为您提起离婚诉讼的依据。

无论您选择哪种方式，都请确保所提供的材料真实有效，并符合法律法规的要求。同时，在提起离婚诉讼前，建议您充分了解相关法律法规及诉讼程序，以便更好地维护自己的合法权益。

综上所述，结婚证在对方手中并不影响您通过合法途径起诉离婚。您可以根据自己的实际情况选择最适合自己的方式来启动离婚诉讼程序，并依法维护自己的权益。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。