即使结婚证在对方手中，您依然可以依法起诉离婚，维护自身合法权益。以下是从不同角度为您详细分析的解答：
一、法律途径：补办结婚证或开具婚姻关系证明
补办结婚证：
- 您可以携带本人身份证、户口本等相关证件，前往原办理婚姻登记的机关或一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请补办结婚证。
- 婚姻登记机关会对您的婚姻登记档案进行查证，确认属实后，为您补发结婚证。
- 补办完成后，您即可凭借补办的结婚证、起诉状、身份证以及相关证据材料，向有管辖权的法院提起离婚诉讼。
开具婚姻关系证明：
- 若补办结婚证不便，您可选择持本人身份证、户口本等材料，前往婚姻登记机关申请开具婚姻关系证明。
- 该婚姻关系证明与结婚证具有同等法律效力，能够作为证明双方婚姻关系的有效凭证。
- 凭借婚姻关系证明、起诉状、身份证及其他相关证据材料，您可向法院提起离婚诉讼。
二、其他证明材料：辅助证明婚姻关系
- 在某些情况下，居委会、村委会出具的证明材料，或者双方生育子女的出生证明等材料，结合双方共同生活的事实证据，也可以辅助证明双方存在婚姻关系，从而提起离婚诉讼。
- 需要注意的是，无论选择哪种方式，您都应确保所提供的材料真实有效，并符合法律法规的要求。
三、起诉离婚的具体流程
准备材料：
- 起诉状：明确您的诉讼请求和事实理由。
- 身份证：证明您的身份。
- 婚姻关系证明：补办的结婚证或婚姻登记机关开具的婚姻关系证明。
- 相关证据材料：如证明夫妻感情破裂的证据、财产分割的证据等。
向法院提起诉讼：
- 您应向有管辖权的法院提交上述材料，并申请立案。
- 法院受理案件后，会安排开庭审理。
法院审理与判决：
- 法院会根据双方提供的证据和事实，认定夫妻感情是否确已破裂。
- 若认定夫妻感情确已破裂且调解无效，法院会判决准予离婚。
四、法律建议与风险提示
- 提前准备：在起诉离婚前，建议您提前收集好相关证据材料，如聊天记录、转账记录、照片视频等，以证明夫妻感情破裂或财产状况。
- 咨询专业律师：虽然我可以为您提供法律咨询，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在起诉离婚前，建议您根据案件的复杂程度，考虑是否需要咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
- 注意诉讼时效：离婚诉讼没有明确的诉讼时效限制，但建议您在发现夫妻感情破裂后尽快提起诉讼，以免因时间拖延而影响案件的审理结果。
总结：结婚证在对方手中并不影响您通过合法途径起诉离婚。您可根据实际情况选择最适合自己的方式来启动离婚诉讼程序，并依法维护自身权益。如果您在起诉离婚过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。