结论前置：在故意克扣工资不发，但在起诉或仲裁期间发放了的情况下，您仍然可以依据之前克扣工资的事实，继续推进仲裁或诉讼程序，要求确认用人单位的违法行为并可能获得相应的赔偿或补偿。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按时足额支付劳动者的工资，不得克扣或者无故拖欠。若用人单位存在克扣工资的行为，劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
二、仲裁或诉讼期间的工资发放情况对案件的影响
不影响违法事实的认定：
- 即使用人单位在仲裁或诉讼期间补发了之前克扣的工资，这并不改变其之前存在克扣工资的违法事实。仲裁机构或法院在审理案件时，会依据事实和法律进行裁决，不会因为用人单位在仲裁或诉讼期间的补发行为而否定其之前的违法行为。
可能影响赔偿或补偿的计算：
- 如果用人单位在仲裁或诉讼期间补发了工资，那么在计算赔偿或补偿时，可能不再需要考虑这部分已经补发的工资。但是，如果克扣工资的行为给劳动者造成了其他损失（如利息损失、精神损害等），劳动者仍然可以要求用人单位进行赔偿。
三、您的权利与应对策略
继续推进仲裁或诉讼程序：
- 您有权继续推进仲裁或诉讼程序，要求确认用人单位的违法行为，并可能获得相应的赔偿或补偿。在仲裁或诉讼过程中，您可以提供证据证明用人单位之前存在克扣工资的行为，以及该行为给您造成的损失。
要求用人单位承担违法成本：
- 除了要求补发工资外，您还可以要求用人单位承担因克扣工资而产生的违法成本，如支付赔偿金、加付赔偿金等。具体赔偿标准可能因地区和案件具体情况而有所不同，您可以咨询当地劳动争议仲裁委员会或法院以获取更准确的信息。
保留相关证据：
- 在处理此类纠纷时，保留相关证据至关重要。您应妥善保管与工资支付相关的证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等。这些证据将有助于您在仲裁或诉讼过程中证明自己的主张。
四、可能的法律后果
用人单位被确认违法：
- 如果仲裁机构或法院确认用人单位存在克扣工资的违法行为，用人单位可能需要承担补发工资、支付赔偿金等法律责任。
对用人单位的信用影响：
- 此类违法行为还可能对用人单位的信用产生负面影响，影响其未来的招聘、融资等经营活动。
建议：面对用人单位故意克扣工资的行为，即使其在仲裁或诉讼期间补发了工资，您仍然有权继续推进仲裁或诉讼程序，要求确认其违法行为并可能获得相应的赔偿或补偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。