您好，关于您提出的“军人能和有父亲有案底的人结婚吗”这一问题，我们可以从两个方面来详细解答：

首先，从结婚登记的法律条件来看，军人结婚与普通人结婚在法律程序上并无本质区别。根据《婚姻登记工作规范》及相关法律法规，结婚登记主要关注的是双方是否满足以下条件：

1. 双方自愿结婚；
2. 男方不得早于22周岁，女方不得早于20周岁；
3. 双方均无配偶（未婚、离婚、丧偶）；
4. 双方没有直系血亲和三代以内旁系血亲关系；
5. 提交必要的证件和材料，如身份证、军人证件（对于现役军人）、以及无配偶和血亲关系的声明等。

在这些条件中，并没有提及对方家庭成员的犯罪记录或案底作为结婚登记的障碍。因此，从法律程序的角度来看，军人与有父亲有案底的人结婚，在结婚登记这一环节是不受影响的。

其次，我们再来考虑军人婚姻可能涉及的特殊方面，即政治考核。虽然结婚登记本身不涉及政治考核，但军人的婚姻有时可能会受到更严格的审查，尤其是在涉及政治忠诚和背景调查时。不过，这种审查通常更侧重于军人本人及其直接家庭成员（如配偶、父母、子女）的政治表现和背景。

对于您提到的“有父亲有案底”的情况，除非该案底涉及危害国家安全、组织或参与非法组织等严重政治问题，否则一般不会直接影响军人的婚姻选择。而且，即使存在这样的案底，也需要根据具体情况和政治考核组的综合判断来确定是否对军人的婚姻产生影响。

综上所述，军人与有父亲有案底的人结婚，在法律程序上是不受阻碍的。但考虑到军人职业的特殊性，建议在结婚前进行充分的沟通和了解，确保双方在政治立场、价值观等方面达成共识，并咨询相关部门或专业人士以获取更具体的指导和建议。希望这些解答能对您有所帮助。