在处理肇事司机不是车主的交通事故时，我们首先要明确的是，责任认定和赔偿问题需要综合考虑多种因素。以下是我为您详细梳理的处理流程和责任认定原则：
一、责任主体认定
一般原则：
- 责任主体通常根据“运行支配”和“运行利益”两个标准来确定。即，谁对车辆的运行具有支配和控制权利，以及谁从车辆运行中获利，谁就可能需要承担赔偿责任。
具体情形下的责任划分：
- 租赁、借用等导致分离：如果车辆是租赁或借用的，且发生交通事故属于机动车一方责任，那么由机动车使用人（即肇事司机）承担赔偿责任。但如果机动车所有人或管理人有过错，比如明知车辆有故障仍出借，那么他们也需要承担相应的责任。
- 车辆被盗抢：如果车辆被盗抢后发生交通事故，那么由盗窃人、抢劫人或抢夺人承担责任。如果与机动车使用人不是同一人，则两者承担连带责任。保险公司垫付抢救费用的，有权向责任人追偿。
- 未经允许驾驶：如果未经允许驾驶他人机动车发生事故，由机动车使用人承担责任。但如果机动车所有人或管理人有过错，比如未妥善保管车辆，他们也需要承担相应的责任。
- 转让拼装或报废车辆：如果转让的是拼装或报废机动车，且发生事故，那么转让人和受让人需要承担连带责任。
- 雇佣关系：如果肇事司机与车主是雇佣关系，那么车主需要承担赔偿责任。但如果司机故意或过失造成事故，车主和司机需要承担连带责任，车主在赔偿后可以向司机索赔。
二、事故处理流程
确保安全与报警：
- 发生事故后，首先要确保人员安全，并及时报警。等待交警勘查现场并出具交通事故责任认定书，这是后续处理的重要依据。
记录现场情况：
- 通过拍照、录像等方式记录事故现场，包括车辆位置、损坏情况、人员受伤情况等，以备后续处理时使用。
联系保险公司：
- 及时联系车辆保险公司，向其报案并申请理赔。保险公司会根据责任认定结果和保险条款进行赔偿。
协商赔偿：
- 根据责任认定结果，受害者与肇事司机、车主及保险公司协商赔偿项目和金额。赔偿项目包括但不限于医疗费、误工费、护理费、交通费、营养费等。
提起诉讼：
- 如果协商不成，受害者可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求相关责任方承担赔偿责任。在诉讼过程中，需要提供充分证据支持诉讼请求。
三、保险与赔偿
保险公司责任：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，保险公司应在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内先行赔偿。这意味着，无论责任如何划分，保险公司都需要在限额内承担赔偿责任。
依法赔偿：
- 事故造成的人身伤害或财产损失，应依法承担赔偿责任。赔偿项目和金额需要根据实际情况和法律法规进行确定。
综上所述，处理肇事司机不是车主的交通事故时，我们需要明确责任主体、遵循相关法律法规，并按照既定流程进行处理。同时，保险公司也应在责任限额内承担先行赔偿责任。如果双方无法就赔偿达成一致，可以通过法律途径解决争议。希望这些信息能对您有所帮助。