母亲将房产证更名给儿子，同时涉及借款欠款的，需通过书面协议明确双方权利义务，建议采用“附条件赠与”或“买卖合同+借款协议”两种方式处理。具体操作及注意事项如下：
一、附条件赠与协议（推荐优先使用）
若母亲希望将房产赠与儿子，但需儿子承担还款义务的，可签订《附条件赠与协议》，明确约定：
- 赠与条件：母亲将房产无偿赠与儿子，但儿子需在约定时间内偿还母亲对第三方的借款（或直接偿还给母亲）；
- 违约责任：若儿子未按期还款，母亲有权撤销赠与并收回房产；
- 过户时间：可约定在儿子还清借款后办理过户，或先过户但保留母亲对房产的抵押权（需办理抵押登记）。
法律依据：
根据《民法典》第663条，受赠人不履行赠与合同约定的义务，赠与人可撤销赠与。此方式可确保母亲在儿子违约时收回房产，降低风险。
二、买卖合同+借款协议（需实际支付对价）
若母亲希望以买卖形式过户房产，同时儿子需偿还借款的，需分两步操作：
- 签订借款协议：母亲与儿子签订《借款协议》，明确借款金额、利息、还款期限等；
- 签订买卖合同：母亲与儿子签订《房屋买卖合同》，约定儿子以借款作为购房款支付给母亲（需实际转账或留痕），并办理过户。
风险提示：
- 需确保借款协议与买卖合同金额一致，避免被认定为“名为买卖实为借贷”的虚假交易；
- 若儿子未还款，母亲需通过诉讼主张债权，但房产已过户可能面临执行风险。
三、关键操作建议
- 书面协议：无论选择哪种方式，均需签订书面协议并公证，避免口头约定无效；
- 资金流水：若涉及借款，需保留转账记录或收条，证明资金往来；
- 过户登记：若需先过户，建议同步办理抵押登记（附条件赠与）或保留借款协议原件；
- 税务合规：赠与或买卖均需缴纳税费，建议提前咨询税务部门。
总结：
- 若母亲希望保留房产控制权，推荐使用附条件赠与协议；
- 若需明确债权债务关系，可选择买卖合同+借款协议，但需注意操作合规性。
如有具体案例或细节需进一步分析，可直接向我咨询。